UAB Digital Repository of Documents 22 records found  1 - 10nextend  jump to record: Search took 0.01 seconds. 
1.
11 p, 1.1 MB Optimized next-generation sequencing genotype-haplotype calling for genome variability analysis / Navarro Fernández, Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Nevado, Bruno (University of Oxford. Department of Plant Sciences) ; Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Vera Rodríguez, Gonzalo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramos Onsins, Sebastián E. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The accurate estimation of nucleotide variability using next-generation sequencing data is challenged by the high number of sequencing errors produced by new sequencing technologies, especially for nonmodel species, where reference sequences may not be available and the read depth may be low due to limited budgets. [...]
2017
Evolutionary bioinformatics, Vol. 13, (August 2017) , p. 1-11  
2.
6 p, 1.2 MB Approaching long genomic regions and large recombination rates with msParSm as an alternative to MaCS / Montemuiño, Carlos (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Espinosa Morales, Antonio Miguel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Moure López, Juan Carlos (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Vera Rodríguez, Gonzalo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Ramos Onsins, Sebastián E. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The msParSm application is an evolution of msPar, the parallel version of the coalescent simulation program ms, which removes the limitation for simulating long stretches of DNA sequences with large recombination rates, without compromising the accuracy of the standard coalescence. [...]
2016 - 10.4137/EBO.S40268
Evolutionary bioinformatics online, Vol. 12 (Oct. 2016) , p. 223-228  
3.
7 p, 380.5 KB Identification of microRNAs in PCV2 subclinically infected pigs by high throughput sequencing / Núñez-Hernández, Fernando (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Pérez, Lester J. (Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria (La Habana, Cuba)) ; Muñoz, Marta (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Vera Rodríguez, Gonzalo (Centre de Recerca en AgriGenòmica) ; Tomás, Anna (Fundació d ́Investigació Sanitària de les Illes Balears) ; Egea, Raquel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Córdoba, Sarai (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Segalés Coma, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i Anatomia Animals) ; Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Núñez, José I (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Porcine circovirus type 2 (PCV2) is the essential etiological infectious agent of PCV2-systemic disease and has been associated with other swine diseases, all of them collectively known as porcine circovirus diseases. [...]
2015 - 10.1186/s13567-014-0141-4
Veterinary Research, Vol. 46 (march 2015)  
4.
5 p, 582.8 KB Evaluation of the capability of the PCV2 genome to encode miRNAs : lack of viral miRNA expression in an experimental infection / Núñez Hernández, Fernando (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Pérez, Lester J ; Vera Rodríguez, Gonzalo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Córdoba, Sarai (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Segalés Coma, Joaquim (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Núñez Garrote, José Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona, Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), UAB-IRTA)
Porcine circovirus type 2 (PCV2) is a ssDNA virus causing PCV2-systemic disease (PCV2-SD), one of the most important diseases in swine. MicroRNAs (miRNAs) are a new class of small non-coding RNAs that regulate gene expression post-transcriptionally. [...]
2015 - 10.1186/s13567-015-0181-4
Veterinary research, Vol. 46 (May 2015) , p. 1-5  
5.
13 p, 590.3 KB miRNA Expression Profile Analysis in Kidney of Different Porcine Breeds / Timoneda i Heredia, Oriol (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Balcells Ortega, Ingrid (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Núñez Garrote, José Ignacio (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Egea Sánchez, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Vera Rodríguez, Gonzalo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Castelló, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Tomas, Anna ; Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal)
MicroRNAs (miRNAs) are important post-transcriptional regulators in eukaryotes that target mRNAs repressing their expression. The uncertain process of pig domestication, with different origin focuses, and the selection process that commercial breeds suffered, have generated a wide spectrum of breeds with clear genetic and phenotypic variability. [...]
2013 - 10.1371/journal.pone.0055402
PLoS one, Vol. 8 Issue 1 (January 2013) , p. e55402  
6.
7 p, 1.2 MB designGG : an R-package and web tool for the optimal design of genetical genomics experiments / Li, Yang (University of Groningen. Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (Haren, Països Baixos)) ; Swertz, Morris A. (University of Groningen. Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (Haren, Països Baixos)) ; Vera Rodríguez, Gonzalo (University of Groningen. Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (Haren, Països Baixos)) ; Fu, Jingyuan (University of Groningen. Department of Genetics (Groningen, Països Baixos)) ; Breitling, Rainer (University of Groningen. Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (Haren, Països Baixos)) ; Jansen, Ritsert C. (University of Groningen. Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (Haren, Països Baixos))
Background: High-dimensional biomolecular profiling of genetically different individuals in one or more environmental conditions is an increasingly popular strategy for exploring the functioning of complex biological systems. [...]
2009 - 10.1186/1471-2105-10-188
BMC Bioinformatics, Vol. 10, N. 188 (June 2009) , p. 1-7  
7.
86 p, 2.4 MB ProyGes : soporte de gestión de proyectos / Carrasco Morgado, Javier ; Vera Rodríguez, Gonzalo ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La aplicación tiene como objetivo llegar a la comunidad de alumnos, los cuales no pueden tener reuniones presenciales debido a su situación geográfica. La aplicación dispone de un conjunto de herramientas para poder centralizar toda la información que los usuarios vayan generando durante el desarrollo de los proyectos. [...]
L'aplicació té com objectiu arribar a la comunitat d'alumnes, els quals no poden tenir reunions presencials atesa la seva situació geogràfica. L'aplicació disposa d'un seguit d'eines per poder centralitzar tota la informació que els usuaris vagin generant durant el desenvolupament dels projectes. [...]
The application aims to reach those students who are not able to attend their meetings due to their geographical location. The application has a set of tools to centralize all the information that the university students generate during their projects development. [...]

2013  
8.
6 p, 601.4 KB R/parallel – speeding up bioinformatics analysis with R / Vera Rodríguez, Gonzalo (University of Groningen. Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (Haren, Països Baixos)) ; Jansen, Ritsert C. (University of Groningen. Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (Haren, Països Baixos)) ; Suppi Boldrito, Remo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius)
Background: R is the preferred tool for statistical analysis of many bioinformaticians due in part to the increasing number of freely available analytical methods. Such methods can be quickly reused and adapted to each particular experiment. [...]
2008 - 10.1186/1471-2105-9-390
BMC Bioinformatics, Vol. 9, N. 390 (September 2008) , p. 1-6  
9.
136 p, 2.0 MB R/parallel : parallel computing for R in non-dedicated environments / Vera Rodríguez, Gonzalo ; Suppi Boldrito, Remo, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius
Traditionally, parallel computing has been associated with special purpose applications designed to run in complex computing clusters, specifically set up with a software stack of dedicated libraries together with advanced administration tools to manage co Traditionally, parallel computing has been associated with special purpose applications designed to run in complex computing clusters, specifically set up with a software stack of dedicated libraries together with advanced administration tools to manage complex IT infrastructures. [...]
[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2013  
10.
96 p, 6.3 MB Simulador de productivitat en una explotació lletera per dispositius mòbils / Ramos Morera, David ; Vera Rodríguez, Gonzalo ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
En un projecte anterior es va desenvolupar una aplicació web.
En un proyecto anterior se desarrolló una aplicación web en.
In a previous project there was developed a web application in.

2013  

UAB Digital Repository of Documents : 22 records found   1 - 10nextend  jump to record:
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.