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1.
9 p, 1.8 MB An improved assembly and annotation of the melon (Cucumis melo L.) reference genome / Ruggieri, Valentino (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Argyris, Jason (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pujol, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Yano, Ryoichi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Nonaka, Satoko (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Ezura, Hiroshi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Latrasse, David (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Boualem, Adnane (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Benhamed, Moussa (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Bendahmane, Abdelhafid (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Cigliano, Riccardo Aiese (Sequentia Biotech SL) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech SL) ; Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We report an improved assembly (v3. 6. 1) of the melon (Cucumis melo L. ) genome and a new genome annotation (v4. 0). The optical mapping approach allowed correcting the order and the orientation of 21 previous scaffolds and permitted to correctly define the gap-size extension along the 12 pseudomolecules. [...]
2018 - 10.1038/s41598-018-26416-2
Scientific reports, Vol. 8 (May 2018) , art. 8088  
2.
9 p, 839.2 KB EcoTILLING for the identification of allelic variants of melon eIF4E, a factor that controls virus susceptibility / Nieto, Cristina (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Piron, Florence (Institut national de la recherche agronomique) ; Dalmais, Marion (Institut national de la recherche agronomique) ; Marco, Cristina F. (Estación Experimental "La Mayora") ; Moriones, Enrique (Estación Experimental "La Mayora") ; Gómez-Guillamón, Ma Luisa (Estación Experimental "La Mayora") ; Truniger, Veronica (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Gómez, Pedro (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Aranda, Miguel A. (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Bendahmane, Abdelhafid (Institut national de la recherche agronomique)
Background: translation initiation factors of the 4E and 4G protein families mediate resistance to several RNA plant viruses in the natural diversity of crops. Particularly, a single point mutation in melon eukaryotic translation initiation factor 4E (eIF4E) controls resistance to Melon necrotic spot virus (MNSV) in melon. [...]
Results: a collection of Cucumis spp. was characterised for susceptibility to MNSV and Cucumber vein yellowing virus (CVYV) and used for the implementation of EcoTILLING to identify new allelic variants of eIF4E. [...]

2007 - 10.1186/1471-2229-7-34
BMC plant biology, Vol. 7 (2007) , art. 34  
3.
11 p, 3.1 MB Towards a TILLING platform for functional genomics in piel de sapo melons / González, Mireia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Xu, Meihong (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Esteras, Cristina (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Roig, Cristina (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Monforte, Antonio J. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Troadec, Christelle (Institut National de Recherche Agronomique. Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Pujol, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Nuez, Fernando (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Bendahmane, Abdelhafid (Institut National de Recherche Agronomique. Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Picó, Belén (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana)
BACKGROUND: the availability of genetic and genomic resources for melon has increased significantly, but functional genomics resources are still limited for this crop. TILLING is a powerful reverse genetics approach that can be utilized to generate novel mutations in candidate genes. [...]
2011 - 10.1186/1756-0500-4-289
BMC research notes, Vol. 11 (Aug. 2011) , art. 289  
4.
12 p, 726.6 KB Analysis of expressed sequence tags generated from full-length enriched cDNA libraries of melon / Clepet, Christian (Institut national de la recherche agronomique (França). Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Joobeur, Tarek (Ohio State University) ; Zheng, Yi (Boyce Thompson Institute) ; Jublot, Delphine (Institut national de la recherche agronomique (França). Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Huang, Mingyun (Boyce Thompson Institute) ; Truniger, Veronica (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Boualem, Adnane (Institut national de la recherche agronomique (França). Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Hernandez Gonzalez, Maria Elena (Ohio State University) ; Dolcet Sanjuan, Ramon (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Portnoy, Vitaly (Newe Ya'ar Research Center) ; Mascarell Creus, Albert (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Caño Delgado, Ana I. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Katzir, Nurit (Newe Ya'ar Research Center) ; Bendahmane, Abdelhafid (Institut national de la recherche agronomique (França). Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Giovannoni, Jame J. (Boyce Thompson Institute) ; Aranda, Miguel A. (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fei, Zhangjun (Boyce Thompson Institute)
Background:Melon (Cucumis melo), an economically important vegetable crop, belongs to the Cucurbitaceae family which includes several other important crops such as watermelon, cucumber, and pumpkin. [...]
2011 - 10.1186/1471-2164-12-252
BMC genomics, Vol. 12 (2011) , art. 252  

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