1.
|
|
2.
|
11 p, 1.8 MB |
Clonal Spread and Intra- and Inter-Species Plasmid Dissemination Associated With Klebsiella pneumoniae Carbapenemase-Producing Enterobacterales During a Hospital Outbreak in Barcelona, Spain
/
Marí-Almirall, Marta (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Ferrando, Núria (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Fernández, Mariana José (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Cosgaya, Clara (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Rubio, Elisa (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Muñoz, Laura (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Pellice, Martina (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Vergara, Andrea (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Campo, Irene (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Rodríguez-Serna, Laura (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Santana, Gemina (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Del Río, Ana (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Ciruela, Pilar (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Ballester, Frederic (Hospital Universitari Sant Joan de Reus (Tarragona)) ;
Marco, Francesc (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Martínez, José Antonio (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Soriano, Álex (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Pitart, Cristina (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Vila Estapé, Jordi (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Roca, Ignasi (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Objectives: The study aimed to characterize the clonal spread of resistant bacteria and dissemination of resistance plasmids among carbapenem-resistant Enterobacterales at a tertiary hospital in Catalonia, Spain. [...]
2021 - 10.3389/fmicb.2021.781127
Frontiers in microbiology, Vol. 12 (november 2021)
|
|
3.
|
|
4.
|
15 p, 2.7 MB |
Concordance between Antimicrobial Resistance Phenotype and Genotype of Staphylococcus pseudintermedius from Healthy Dogs
/
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Fábregas, Norma (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Pérez, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Fonticoba, Rocío (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Ferrer i Caubet, Lluís (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Staphylococcus pseudintermedius, a common commensal canine bacterium, is the main cause of skin infections in dogs and is a potential zoonotic pathogen. The emergence of methicillin-resistant S. pseudintermedius (MRSP) has compromised the treatment of infections caused by these bacteria. [...]
2022 - 10.3390/antibiotics11111625
Antibiotics, Vol. 11 (november 2022)
|
|
5.
|
4 p, 292.7 KB |
Whole-Genome Sequencing and De Novo Assembly of 67 Strains Isolated from the Skin of Healthy Dogs
/
Fábregas, Norma (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Pérez, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Fonticoba, Rocío (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Ferrer i Caubet, Lluís (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
We have de novo assembled 67 genomes, with median values of 2. 6 Mbp size and 99. 43% completeness, 2,386 coding sequences, 19 complete rRNAs, 59 tRNAs, and 4 noncoding RNAs. We released 51 single-contig complete genomes and 16 genomes with a circular main contig using Nanopore sequencing.
2022 - 10.1128/mra.00039-22
Microbiology Resource Announcements, Vol. 11 (march 2022)
|
|
6.
|
215 p, 13.0 MB |
From the clinic to the farm : Applying sequencing and de novo assembly to characterize One-Health bacterial pathogens
/
Viñes, Joaquim ;
Francino, Olga, dir. ;
Cuscó, Anna ;
Sánchez Bonastre, Armando, dir.
Les infeccions causades per bacteris resistents a múltiples antibiòtics son una amenaça tant per a la salut animal com la humana degut a la limitació en el tractament, la qual pot portar a complicacions clíniques severes, estades hospitalàries més llargues o, fins i tot, a la mort. [...] Las infecciones causadas por bacterias resistentes a múltiples antibióticos son una amenaza tanto para la salud animal como la humana debido a la limitación en el tratamiento, la cual puede conllevar complicaciones clínicas severas, estancias hospitalarias más largar o incluso la muerte. [...] Multi-drug resistant bacteria infections are a threat to animal and human health due to the limitation in treatment, which can lead to severe clinical complications, longer hospital stays, or even death. [...]
2021
|
|
7.
|
|
8.
|
20 p, 9.0 MB |
The microbiota of water buffalo milk during mastitis
/
Catozzi, Carlotta (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Lecchi, Cristina (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria) ;
De Carlo, Esterina (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ;
Vecchio, Domenico (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ;
Martucciello, Alessandra (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ;
Fraulo, Pasquale (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ;
Bronzo, Valerio (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
D'Andreano, Sara (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Ceciliani, Fabrizio (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria)
The aim of this study was to define the microbiota of water buffalo milk during sub-clinical and clinical mastitis, as compared to healthy status, by using high-throughput sequencing of the 16S rRNA gene. [...]
2017 - 10.1371/journal.pone.0184710
PloS one, Vol. 12 (september 2017)
|
|
9.
|
|
10.
|
22 p, 4.3 MB |
Digestive microbiota is different in pigs receiving antimicrobials or a feed additive during the nursery period
/
Soler, Cassandra (Universitat de Lleida. Departament de Ciència Animal) ;
Goossens, Tim (Nutriad International N.V., Dendermonde, Belgium) ;
Bermejo, Alvaro (Nutriad International N.V., Dendermonde, Belgium) ;
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Fraile, Lorenzo (Universitat de Lleida. Departament de Ciència Animal)
Antimicrobials have been used in a prophylactic way to decrease the incidence of digestive disorders during the piglet post-weaning period. Nowadays, it is urgent to reduce their consumption in livestock to address the problem of antimicrobial resistance. [...]
2018 - 10.1371/journal.pone.0197353
PloS one, Vol. 13 (may 2018)
|
|