|
1.
|
|
17 p, 2.4 MB |
Quasispecies Fitness Partition to Characterize the Molecular Status of a Viral Population. Negative Effect of Early Ribavirin Discontinuation in a Chronically Infected HEV Patient
/
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ibañez-Lligoña, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Adombie, Caroline Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Pintó, Rosa (Universitat de Barcelona) ;
Guix, Susana (Universitat de Barcelona) ;
Bosch, Albert (Universitat de Barcelona) ;
Domingo, Esteban (Instituto de Salud Carlos III) ;
Gallego, Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Perales Viejo, Celia (Universidad Autónoma de Madrid) ;
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
The changes occurring in viral quasispecies populations during infection have been monitored using diversity indices, nucleotide diversity, and several other indices to summarize the quasispecies structure in a single value. [...]
2022 -  10.3390/ijms232314654
International journal of molecular sciences, Vol. 23 (november 2022)
|
|
|
2.
|
|
11 p, 1.5 MB |
The frequency of defective genomes in Omicron differs from that of the Alpha, Beta and Delta variants
/
Campos, Carolina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia-Cehic, D. (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Borras Bermejo, Blanca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Parés-Badell, Oleguer (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Adombi, Caroline Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ibañez-Lligoña, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esperalba, Juliana (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Codina, María Gema (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Saubí, Narcis (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
The SARS-CoV-2 Omicron variant emerged showing higher transmissibility and possibly higher resistance to current COVID-19 vaccines than other variants dominating the global pandemic. In March 2020 we performed a study in clinical samples, where we found that a portion of genomes in the SARS-CoV-2 viral population accumulated deletions immediately before the S1/S2 cleavage site (furin-like cleavage site, PRRAR/S) of the spike gene, generating a frameshift and appearance of a premature stop codon. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-24918-8
Scientific reports, Vol. 12 (december 2022)
|
|
|
3.
|
|
16 p, 141.1 KB |
Medicina i Cirurgia IV [103608]
/
Pedro-Botet Montoya, María Luisa ;
Esteban Mur, Juan Ignacio ;
Sahuquillo Barris, Joan ;
Julián Ibáñez, Juan Francisco ;
Illa Sendra, Maria Isabel ;
de Benito Hernández, María Natividad ;
Vilallonga Puy, Ramon ;
Rigla Cros, Maria Mercedes ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Facultat de Medicina
1 Neurologia: La matèria Neurologia-Neurocirurgia dins de l'assignatura MIC IV està programada en cinquè curs del Grau de Medicina. Al final del període de formació, on el coneixement de l'alumne li permet afrontar al pacient amb molèsties que impliquen el sistema nerviós, per fer un diagnòstic sindròmic, d'acord amb la simptomatologia observada, plantejar una topografia lesional, el que permetrà d'acord amb la clínica i les proves complementàries, establir la causa etiològica, per permetre la realització d'un pronòstic i tractament. [...]
1 Objectives and contextualization Neurology: The subject Neurology-Neurosurgery within the subject MAS IV is scheduled in the fifth year of the Degree in Medicine. At the end of the training period, the knowledge acquired by the student allows him to face the patient with diseases of the nervous system, to make a syndromic diagnosis, in agreement with the observed symptomatology, to localize a lesion topography, which will allow according to the clinical status and the complementary tests, establish the aetiological cause, allowing to establish a prognosis and treatment. [...]
Neurología: La materia Neurología-Neurocirugía dentro de la asignatura MIC IV está programada en quinto curso del 1 La materia Neurología-Neurocirugía dentro de la asignatura MIC IV está programada en quinto curso del Grado de Medicina. [...]
2022-23
Grau en Medicina [1192]
3 documents
|
|
|
4.
|
|
18 p, 2.7 MB |
Partial restoration of immune response in Hepatitis C patients after viral clearance by direct-acting antiviral therapy
/
Llorens-Revull, Meritxell (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Costafreda Salvany, Maria Isabel (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya)) ;
Rico, Angie (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya)) ;
Guerrero Murillo, Mercedes (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Soria, Maria Eugenia (Universidad Autónoma de Madrid) ;
Píriz-Ruzo, Sofía (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Vargas-Accarino, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gabriel-Medina, Pablo (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Perales Viejo, Celia (Universidad Autónoma de Madrid) ;
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Sauleda, Silvia (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya)) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Bes, Marta (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya))
HCV CD4+ and CD8+ specific T cells responses are functionally impaired during chronic hepatitis C infection. DAAs therapies eradicate HCV infection in more than 95% of treated patients. However, the impact of HCV elimination on immune responses remain controversial. [...]
2021 - 10.1371/journal.pone.0254243
PloS one, Vol. 16 (july 2021)
|
|
|
5.
|
|
15 p, 703.1 KB |
Ultra-Deep Pyrosequencing Detects Conserved Genomic Sites and Quantifies Linkage of Drug-Resistant Amino Acid Changes in the Hepatitis B Virus Genome
/
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ortega, Israel (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Domingo, Esteban (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Cubero, María Dolores (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Camós Anguila, Sílvia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ferrer, Carles (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Sánchez, Alex (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Jardí, Rosendo (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Schaper, Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Homs, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Guardia Massó, Jaume (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban, Rafael (Esteban Mur) (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Selection of amino acid substitutions associated with resistance to nucleos(t)ide-analog (NA) therapy in the hepatitis B virus (HBV) reverse transcriptase (RT) and their combination in a single viral genome complicates treatment of chronic HBV infection and may affect the overlapping surface coding region. [...]
2012 - 10.1371/journal.pone.0037874
PloS one, Vol. 7 (may 2012)
|
|
|
6.
|
|
13 p, 470.0 KB |
Ultra-Deep Pyrosequencing (UDPS) Data Treatment to Study Amplicon HCV Minor Variants
/
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Cubero, María Dolores (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Perales Viejo, Celia (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Casillas, Rosario (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Alvarez-Tejado, Miguel (Roche Diagnostics, Sant Cugat del Vallès) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Guardia Massó, Jaume (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona)
We have investigated the reliability and reproducibility of HCV viral quasispecies quantification by ultra-deep pyrosequencing (UDPS) methods. Our study has been divided in two parts. First of all, by UDPS sequencing of clone mixes samples we have established the global noise level of UDPS and fine tuned a data treatment workflow previously optimized for HBV sequence analysis. [...]
2013 - 10.1371/journal.pone.0083361
PloS one, Vol. 8 (december 2013)
|
|
|
7.
|
|
19 p, 2.2 MB |
Lethal Mutagenesis of Hepatitis C Virus Induced by Favipiravir
/
de Ávila, Ana Isabel (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ;
Gallego, Isabel (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Soria, Maria Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gregori i Font, Josep (Roche Diagnostics (Sant Cugat)) ;
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Rice, Charles M. (The Rockefeller University) ;
Domingo, Esteban (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Perales Viejo, Celia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Lethal mutagenesis is an antiviral approach that consists in extinguishing a virus by an excess of mutations acquired during replication in the presence of a mutagen. Here we show that favipiravir (T-705) is a potent mutagenic agent for hepatitis C virus (HCV) during its replication in human hepatoma cells. [...]
2016 - 10.1371/journal.pone.0164691
PloS one, Vol. 11 (october 2016)
|
|
|
8.
|
|
17 p, 3.0 MB |
Rare haplotype load as marker for lethal mutagenesis
/
Gregori i Font, Josep (Roche Diagnostics) ;
Soria, María Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gallego, Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Guerrero Murillo, Mercedes (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Perales Viejo, Celia (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa)
RNA viruses replicate with a template-copying fidelity, which lies close to an extinction threshold. Increases of mutation rate by nucleotide analogues can drive viruses towards extinction. This transition is the basis of an antiviral strategy termed lethal mutagenesis. [...]
2018 - 10.1371/journal.pone.0204877
PloS one, Vol. 13 (october 2018)
|
|
|
9.
|
|
15 p, 3.3 MB |
Pipeline for specific subtype amplification and drug resistance detection in hepatitis C virus
/
Soria, María Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Chen, Qian (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Llorens, Meritxell (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
de Ávila, Ana Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Beach, Nathan M. (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Buti, Maria (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Esteban, Rafael (Esteban Mur) (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Perales Viejo, Celia (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa)
Despite the high sustained virological response rates achieved with current directly-acting antiviral agents (DAAs) against hepatitis C virus (HCV), around 5-10% of treated patients do not respond to current antiviral therapies, and basal resistance to DAAs is increasingly detected among treatment-naïve infected individuals. [...]
2018 - 10.1186/s12879-018-3356-6
BMC Infectious diseases, Vol. 18 (september 2018)
|
|
|
10.
|
|
16 p, 141.1 KB |
Medicina i Cirurgia IV [103608]
/
Webb Youdale, Susan ;
Esteban Mur, Juan Ignacio ;
Sahuquillo Barris, Joan ;
Julián Ibáñez, Juan Francisco ;
Illa Sendra, Maria Isabel ;
Pedro-Botet Montoya, María Luisa ;
de Benito Hernández, María Natividad ;
Vilallonga Puy, Ramon ;
Rigla Cros, Maria Mercedes ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Facultat de Medicina
1 Neurologia: La matèria Neurologia-Neurocirurgia dins de l'assignatura MIC IV està programada en cinquè curs del Grau de Medicina. Al final del període de formació, on el coneixement de l'alumne li permet afrontar al pacient amb molèsties que impliquen el sistema nerviós, per fer un diagnòstic sindròmic, d'acord amb la simptomatologia observada, plantejar una topografia lesional, el que permetrà d'acord amb la clínica i les proves complementàries, establir la causa etiològica, per permetre la realització d'un pronòstic i tractament. [...]
1 Objectives and contextualization Neurology: The subject Neurology-Neurosurgery within the subject MAS IV is scheduled in the fifth year of the Degree in Medicine. At the end of the training period, the knowledge acquired by the student allows him to face the patient with diseases of the nervous system, to make a syndromic diagnosis, in agreement with the observed symptomatology, to localize a lesion topography, which will allow according to the clinical status and the complementary tests, establish the aetiological cause, allowing to establish a prognosis and treatment. [...]
1 Neurología: La materia Neurología-Neurocirugía dentro de la asignatura MIC IV está programada en quinto curso del Grado de Medicina. Al final del periodo de formación, dónde el conocimiento del alumno le permite afrontar al paciente con molestias que implican el sistema nervioso, para hacer un diagnóstico sindrómico, de acuerdo con la sintomatología observada, plantear una topografía lesional, lo que permitirá de acuerdo con la clínica y las pruebas complementarias, establecer la causa etiológica, para permitir la realización de un pronóstico y tratamiento. [...]
2021-22
Grau en Medicina [1192]
3 documents
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
