|
1.
|
|
15 p, 19.7 MB |
A single-cell tumor immune atlas for precision oncology
/
Nieto, Paula (Centre de Regulació Genòmica) ;
Elosua-Bayes, Marc (Centre de Regulació Genòmica) ;
Trincado Alonso, Juan Luis, 1987- (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marchese, Domenica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Massoni-Badosa, Ramon (Centre de Regulació Genòmica) ;
Salvany, Maria (Institut Recerca Biomèdica de Barcelona) ;
Henriques, Ana (Institut Recerca Biomèdica de Barcelona) ;
Nieto Sáchica, Juan Camilo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aguilar-Fernández, Sergio (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mereu, Elisabetta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz, Sara (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lorden, Patricia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Chin, Vanessa T. (St. Vincent Hospital Sydney) ;
Kaczorowski, Dominik (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Chan, Chia Ling (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Gallagher, Richard (University of Notre Dame) ;
Chou, Angela (University of Sydney) ;
Planas-Rigol, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Gut, Ivo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Piulats, Josep M. (Institut Català d'Oncologia) ;
Seoane Suárez, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Powell, Joseph E. (University of New South Wales) ;
Batlle, Eduard (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra)
2021 -  10.1101/gr.273300.120
Genome research, Vol. 31 Núm. 10 (october 2021) , p. 1913-1926
|
|
|
2.
|
|
10 p, 4.1 MB |
Immune cell profiling of the cerebrospinal fluid enables the characterization of the brain metastasis microenvironment
/
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Planas-Rigol, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Trincado Alonso, Juan Luis, 1987- (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Bonfill-Teixidor, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Arias, Alexandra (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Marchese, Domenica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Serna, Garazi (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Pedrosa, Leire (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Iurlaro, Raffaella (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Martinez-Ricarte, Fran (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Escudero, Laura (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Cordero Asanza, Esteban (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Cicuendez, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Ruiz, Sara (Centre de Regulació Genòmica) ;
Parra, Genís (Centre de Regulació Genòmica) ;
Nuciforo, Paolo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Gonzalez, Josep (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Pineda, Estela (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Sahuquillo Barris, Juan (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Tabernero, Josep (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra) ;
Seoane Suárez, Joan (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Brain metastases are the most common tumor of the brain with a dismal prognosis. A fraction of patients with brain metastasis benefit from treatment with immune checkpoint inhibitors (ICI) and the degree and phenotype of the immune cell infiltration has been used to predict response to ICI. [...]
2021 - 10.1038/s41467-021-21789-x
Nature communications, Vol. 12 (march 2021)
|
|
|
3.
|
|
16 p, 1.4 MB |
Sampling time-dependent artifacts in single-cell genomics studies
/
Massoni-Badosa, R. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Iacono, G. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Kulis, M. (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Palau, Núria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Marchese, Domenica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rodríguez-Ubreva, Javier (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Ballestar, Esteban (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Rodriguez-Esteban, G. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marsal, S. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Aymerich, Marta (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Colomer, Dolors (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Campo, Elias (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Julià Cano, Antonio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Martín-Subero, Jose Ignacio (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Robust protocols and automation now enable large-scale single-cell RNA and ATAC sequencing experiments and their application on biobank and clinical cohorts. However, technical biases introduced during sample acquisition can hinder solid, reproducible results, and a systematic benchmarking is required before entering large-scale data production. [...]
2020 - 10.1186/s13059-020-02032-0
Genome biology, Vol. 21 Núm. 1 (november 2020) , p. 112
|
|
|
4.
|
|
26 p, 7.4 MB |
Three-dimensional genomic structure and cohesin occupancy correlate with transcriptional activity during spermatogenesis
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Salvà Castro, Judith (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gomez Hernández, Laura (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martín Pendas, Alberto (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica) ;
Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ;
Martí Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Mammalian gametogenesis involves dramatic and tightly regulated chromatin remodeling, whose regulatory pathways remain largely unexplored. Here, we generate a comprehensive high-resolution structural and functional atlas of mouse spermatogenesis by combining in situ chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), RNA sequencing (RNA-seq), and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) of CCCTC-binding factor (CTCF) and meiotic cohesins, coupled with confocal and super-resolution microscopy. [...]
2019 - 10.1016/j.celrep.2019.06.037
Cell reports, Vol. 28, issue 2 (Jul. 2019) , p. 352-367
|
|
|
5.
|
|
4 p, 471.8 KB |
Epigenetic loss of the RNA decapping enzyme NUDT16 mediates C-MYC activation in T-cell acute lymphoblastic leukemia
/
Anadón, C. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
van Tetering, G. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Ferreira, H. J. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Moutinho, Catia (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Martínez Cardús, Anna (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Villanueva, Alberto (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Soler, Marta (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Heyn, Holger (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Moran, S (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Castro de Moura, Manuel (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Setien, F. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Vidal, A. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Genescà, Eulàlia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Ribera, Jose-Maria (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Nomdedeu, Josep (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Guil, S. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Esteller, M. (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
2017 - 10.1038/leu.2017.99
Leukemia, Vol. 31 (04 2017) , p. 1622-1625
|
|
|
6.
|
|
14 p, 4.9 MB |
Epigenetic inactivation of the putative DNA/RNA helicase SLFN11 in human cancer confers resistance to platinum drugs
/
Nogales, Vanesa (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Reinhold, William C. (National Cancer Institute (Bethesda, Estats Units d'Amèrica)) ;
Varma, Sudhir (National Cancer Institute (Bethesda, Estats Units d'Amèrica)) ;
Martinez-Cardus, Anna (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Moutinho, Catia (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Moran, S (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Heyn, Holger (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Sebio, Ana (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Barnadas i Molins, Agustí (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Pommier, Yves (National Cancer Institute (Bethesda, Estats Units d'Amèrica)) ;
Esteller, M. (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Platinum-derived drugs such as cisplatin and carboplatin are among the most commonly used cancer chemotherapy drugs, but very few specific molecular and cellular markers predicting differential sensitivity to these agents in a given tumor type have been clearly identified. [...]
2015 - 10.18632/oncotarget.6413
Oncotarget, Vol. 7 (november 2015) , p. 3084-3097
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
