|
1.
|
|
19 p, 2.5 MB |
Circulating miRNAs, isomiRs and small RNA clusters in human plasma and breast milk
/
Rubio, Mercedes (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Bustamante, Mariona (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Hernandez-Ferrer, Carles (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Fernandez-Orth, Dietmar (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Pantano, Lorena (Harvard T.H. Chan School of Public Health (Boston, Estats Units d'Amèrica)) ;
Sarria, Yaris (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Piqué-Borras, Maria (University Children's Hospital Basel (Basilea, Suïssa)) ;
Vellve, Kilian (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Agramunt Garcia, Sílvia (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Carreras Collado, Ramón (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Estivill, Xavier (Hospital Dexeus (Barcelona, Catalunya)) ;
González, Juan Ramón (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Mayor, Alfredo (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Circulating small RNAs, including miRNAs but also isomiRs and other RNA species, have the potential to be used as non-invasive biomarkers for communicable and non-communicable diseases. This study aims to characterize and compare small RNA profiles in human biofluids. [...]
2018 -  10.1371/journal.pone.0193527
PloS one, Vol. 13 (march 2018)
|
|
|
2.
|
|
14 p, 787.7 KB |
A High-Throughput Screening Identifies MicroRNA Inhibitors That Influence Neuronal Maintenance and/or Response to Oxidative Stress
/
Pallarès-Albanell, Joan (Centre de Regulació Genòmica) ;
Zomeño-Abellán, M. Teresa (Centre de Regulació Genòmica) ;
Escaramís, Georgia (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Pantano, Lorena (Harvard T.H. Chan School of Public Health. Department of Biostatistics) ;
Soriano, Aroa (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Segura, Miguel F. (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Martí, Eulàlia (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Small non-coding RNAs (sncRNAs), including microRNAs (miRNAs) are important post-transcriptional gene expression regulators relevant in physiological and pathological processes. Here, we combined a high-throughput functional screening (HTFS) platform with a library of antisense oligonucleotides (ASOs) to systematically identify sncRNAs that affect neuronal cell survival in basal conditions and in response to oxidative stress (OS), a major hallmark in neurodegenerative diseases. [...]
2019 - 10.1016/j.omtn.2019.06.007
Molecular Therapy. Nucleic Acids, Vol. 17 (june 2019) , p. 374-387
|
|
|
3.
|
|
28 p, 2.6 MB |
Functional impact and evolution of a novel human polymorphic inversion that disrupts a gene and creates a fusion transcript
/
Puig Font, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Castellano Esteve, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Pantano, Lorena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Giner-Delgado, Carla (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Izquierdo Fontanills, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gayà Vidal, Magdalena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Lucas Lledó, José Ignacio (Universitat de València. Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva) ;
Esko, Tõnu (Estonian Genome Center) ;
Terao, Chikashi (Kyoto University Graduate School of Medicine) ;
Matsuda, Fumihiko (Center for Genomic Medicine. Kyoto University Graduate School of Medicine) ;
Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Despite many years of study into inversions, very little is known about their functional consequences, especially in humans. A common hypothesis is that the selective value of inversions stems in part from their effects on nearby genes, although evidence of this in natural populations is almost nonexistent. [...]
2015 - 10.1371/journal.pgen.1005495
PLoS Genetics, Vol. 11, issue 10 (2015) , art. e1005495
|
|
|
4.
|
|
14 p, 1.8 MB |
Evolutionary and functional impact of common polymorphic inversions in the human genome
/
Giner-Delgado, Carla (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Villatoro, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Lerga Jaso, Jon (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gayà Vidal, Magdalena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Oliva Pavia, Meritxell (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Castellano Esteve, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Pantano, Lorena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Bitarello, Bárbara D. (Max-Planck-Institut für Evolutionäre Anthropologie) ;
Izquierdo Fontanills, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Noguera, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Olalde, Iñigo (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Delprat Obeaga, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Blancher, Antoine (Centre de Physiopathologie Toulouse-Purpan) ;
Lalueza-Fox, Carles (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Esko, Tõnu (Estonian Genome Center) ;
O'Reilly, Paul F. (King's College London. Institute of Psychiatry, Psychology & Neuroscience) ;
Andrés, Aida M. (Max-Planck-Institut für Evolutionäre Anthropologie) ;
Ferretti, Luca (University of Oxford. Big Data Institute) ;
Puig Font, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Inversions are one type of structural variants linked to phenotypic differences and adaptation in multiple organisms. However, there is still very little information about polymorphic inversions in the human genome due to the difficulty of their detection. [...]
2019 - 10.1038/s41467-019-12173-x
Nature communications, Vol. 10 (2019) , art. 4222
|
|
|
5.
|
|
6 p, 2.9 MB |
InvFEST, a database integrating information of polymorphic inversions in the human genome
/
Martínez Fundichely, Alexander (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Egea, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Ràmia Jesús, Miquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Pantano, Lorena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Puig Font, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
The newest genomic advances have uncovered an unprecedented degree of structural variation throughout genomes, with great amounts of data accumulating rapidly. Here we introduce InvFEST (), a database combining multiple sources of information to generate a complete catalogue of non-redundant human polymorphic inversions. [...]
2013 - 10.1093/nar/gkt1122
Nucleic acids research, Vol. 42 (2014) , art. D1027-D1032
|
|
|
6.
|
|
12 p, 735.8 KB |
The small RNA content of human sperm reveals pseudogene-derived piRNAs complementary to protein-coding genes
/
Pantano, Lorena (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Jodar, Meritxell (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Bak, Mads (University of Copenhagen (Dinamarca)) ;
Ballescà, Josep Lluís (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Tommerup, Niels (University of Copenhagen (Dinamarca)) ;
Oliva Virgili, Rafael (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Vavouri, Tanya (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Abstract. At the end of mammalian sperm development, sperm cells expel most of their cytoplasm and dispose of the majority of their RNA. Yet, hundreds of RNA molecules remain in mature sperm. The biological significance of the vast majority of these molecules is unclear. [...]
2015 - 10.1261/rna.046482.114
RNA, Vol. 21 Núm. 6 (June 2015)
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
