UAB Digital Repository of Documents 53 records found  1 - 10nextend  jump to record: Search took 0.00 seconds. 
1.
12 p, 2.1 MB On the holobiont 'predictome' of immunocompetence in pigs / Calle-García, Joan (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Zingaretti, Laura M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Ballester Devis, Maria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Perez-Enciso, Miguel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Gut microbial composition plays an important role in numerous traits, including immune response. Integration of host genomic information with microbiome data is a natural step in the prediction of complex traits, although methods to optimize this are still largely unexplored. [...]
2023 - 10.1186/s12711-023-00803-4
Genetics, selection, evolution, Vol. 55 (may 2023)  
2.
12 p, 3.2 MB Global analysis of the association between pig muscle fatty acid composition and gene expression using RNA-Seq / Valdés-Hernández, Jesús (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Passols, Magí (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Sebastià, Cristina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Criado Mesas, Lourdes (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Crespo-Piazuelo, Daniel (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Esteve-Codina, Anna (Barcelona Institute of Science and Technology (BIST)) ; Castelló Farré, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Folch, Josep M. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Fatty acids (FAs) play an essential role as mediators of cell signaling and signal transduction, affecting metabolic homeostasis and determining meat quality in pigs. However, FAs are transformed by the action of several genes, such as those encoding desaturases and elongases of FAs in lipogenic tissues. [...]
2023 - 10.1038/s41598-022-27016-x
Scientific reports, Vol. 13 (january 2023)  
3.
14 p, 3.8 MB Disentangling the causal relationship between rabbit growth and cecal microbiota through structural equation models / Mora Fenoll, Mònica (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Velasco-Galilea, María (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Sánchez, Juan Pablo (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Piles, Miriam (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
Background: The effect of the cecal microbiome on growth of rabbits that were fed under different regimes has been studied previously. However, the term "effect" carries a causal meaning that can be confounded because of potential genetic associations between the microbiome and production traits. [...]
2022 - 10.1186/s12711-022-00770-2
Genetics, selection, evolution, Vol. 54 (December 2022) , art. 81  
4.
46 p, 1.5 MB Modeling microRNA-driven post-transcriptional regulation using exon-intron split analysis in pigs / Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cirera, Susanna (University of Copenhagen. Department of Veterinary and Animal Sciences) ; Zingaretti, Laura M. (Universidad Nacional de Villa María) ; Jacobsen, Mette Juul (University of Copenhagen. Department of Veterinary and Animal Sciences) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Jørgensen, Claus B. (University of Copenhagen. Department of Veterinary and Animal Sciences) ; Fredholm, Merete (University of Copenhagen. Department of Veterinary and Animal Sciences) ; Cardoso, Tainã Figueiredo (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
The contribution of microRNAs (miRNAs) to mRNA post-transcriptional regulation has often been explored by the post hoc selection of downregulated genes and determining whether they harbor binding sites for miRNAs of interest. [...]
2022 - 10.1111/age.13238
Animal Genetics, Vol. 53, Issue 5 (October 2022) , p. 613-626  
5.
12 p, 1.4 MB Genetic architecture of innate and adaptive immune cells in pigs / Ballester Devis, Maria (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Jové-Juncà, Teodor (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Pascual, Afra (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; López-Serrano, Sergi (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Crespo-Piazuelo, Daniel (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Hernández-Banqué, Carles (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; González-Rodríguez, Olga (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Quintanilla, Raquel (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Pig industry is facing new challenges that make necessary to reorient breeding programs to produce more robust and resilient pig populations. The aim of the present work was to study the genetic determinism of lymphocyte subpopulations in the peripheral blood of pigs and identify genomic regions and biomarkers associated to them. [...]
2023 - 10.3389/fimmu.2023.1058346
Frontiers in immunology, Vol. 14 (february 2023)  
6.
20 p, 3.9 MB Opportunities and limits of combining microbiome and genome data for complex trait prediction / Perez-Enciso, Miguel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Zingaretti, Laura M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; de los Campos, Gustavo (Michigan State University. Department of Epidemiology & Biostatistics)
Analysis and prediction of complex traits using microbiome data combined with host genomic information is a topic of utmost interest. However, numerous questions remain to be answered: how useful can the microbiome be for complex trait prediction? Are estimates of microbiability reliable? Can the underlying biological links between the host's genome, microbiome, and phenome be recovered? Here, we address these issues by (i) developing a novel simulation strategy that uses real microbiome and genotype data as inputs, and (ii) using variance-component approaches (Bayesian Reproducing Kernel Hilbert Space (RKHS) and Bayesian variable selection methods (Bayes C)) to quantify the proportion of phenotypic variance explained by the genome and the microbiome. [...]
2021 - 10.1186/s12711-021-00658-7
Genetics, selection, evolution, Vol. 53 (August 2021) , art. 65  
7.
18 p, 4.9 MB Understanding host-microbiota interactions in the commercial piglet around weaning / Saladrigas-García, Mireia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; D'angelo, Matilde (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Nutrició i Benestar Animal) ; Ko, Heng-Lun (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Nutrició i Benestar Animal) ; Nolis Fañanas, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Ressonància Magnètica Nuclear) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Folch, Josep M. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Llonch, Pol (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Solà Oriol, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Pérez Hernández, José Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Martín Orúe, Susana M. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Weaning is a critical period in the life of pigs with repercussions on their health and welfare and on the economy of the swine industry. This study aimed to assess the effect of the commercial early weaning on gut microbiota, intestinal gene expression and serum metabolomic response via an integrated-omic approach combining 16S rRNA gene sequencing, the OpenArray gene expression technology and 1 H-NMR spectroscopy. [...]
2021 - 10.1038/s41598-021-02754-6
Scientific reports, Vol. 11 (december 2021)  
8.
1 p, 596.3 KB Correction to : Opportunities and limits of combining microbiome and genome data for complex trait prediction / Perez-Enciso, Miguel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Zingaretti, Laura M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; de los Campos, Gustavo (Michigan State University. Department of Epidemiology & Biostatistics)
2021 - 10.1186/s12711-021-00691-6
Genetics, selection, evolution, Vol. 53 (december 2021)  
9.
13 p, 1.7 MB Supplementation of xylo-oligosaccharides to suckling piglets promotes the growth of fiber-degrading gut bacterial populations during the lactation and nursery periods / González Solé, Francesc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Solà Oriol, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Rodriguez-Prado, Maria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; González Ortiz, Gemma (AB Vista) ; Bedford, Michael R. (AB Vista) ; Pérez Hernández, José Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Grup de Recerca de Nutrició Maneig i Benestar Animal)
Modulating early-life microbial colonization through xylo-oligosacharides (XOS) supplementation represents an opportunity to accelerate the establishment of fiber-degrading microbial populations and improve intestinal health. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-15963-4
Scientific reports, Vol. 12 (july 2022)  
10.
15 p, 1.6 MB Use of Bayes factors to evaluate the effects of host genetics, litter and cage on the rabbit cecal microbiota / Velasco-Galilea, María (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Piles, Miriam (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Varona, Luis (Universidad de Zaragoza) ; Sánchez, Juan Pablo (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
The rabbit cecum hosts and interacts with a complex microbial ecosystem that contributes to the variation of traits of economic interest. Although the influence of host genetics on microbial diversity and specific microbial taxa has been studied in several species (e. [...]
2022 - 10.1186/s12711-022-00738-2
Genetics, selection, evolution, Vol. 54 (June 2022) , art. 46  

UAB Digital Repository of Documents : 53 records found   1 - 10nextend  jump to record:
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.