Depósito Digital de Documentos de la UAB Encontrados 12 registros  1 - 10siguiente  ir al registro: La búsqueda tardó 0.00 segundos. 
1.
12 p, 1.6 MB Development and Evaluation of an Axiom TM 60K SNP Array for Almond (Prunus dulcis) / Duval, Henri (Institut National de la Recherche Agronomique (França)) ; Coindre, Eva (Institut National de la Recherche Agronomique (França)) ; Ramos-Onsins, Sebastian (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Rubio-Cabetas, Maria J. (Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón) ; Martínez-García, Pedro J. (Campus Universitario de Espinardo) ; Wirthensohn, Michelle (Waite Research Institute, University of Adelaide) ; Dhingra, Amit (Washington State University) ; Samarina, Anna (Thermo Fisher Scientific) ; Arús i Gorina, Pere (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
A high-density single nucleotide polymorphism (SNP) array is essential to enable faster progress in plant breeding for new cultivar development. In this regard, we have developed an Axiom 60K almond SNP array by resequencing 81 almond accessions. [...]
2023 - 10.3390/plants12020242
Plants, Vol. 12, Num.2 (January 2023) , art 242  
2.
1 p, 673.7 KB Author Correction : A deletion affecting an LRR-RLK gene co-segregates with the fruit flat shape trait in peach / López-Girona, Elena (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Zhang, Yu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Eduardo, Iban (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Hernández Mora, José R. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Alexiou, Konstantinos G. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Arús i Gorina, Pere (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Aranzana, Maria José (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
2022 - 10.1038/s41598-022-09334-2
Scientific reports, Vol. 12 (March 2022) , art. 5409  
3.
17 p, 1.7 MB A cryptic variation in a member of the Ovate Family Proteins is underlying the melon fruit shape QTL fsqs8.1 / Martínez Martínez, Cecilia (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Gonzalo, Maria José (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Sipowicz, Pablo (Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria - INTA (Argentina)) ; Campos, Manuel (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Martínez Fernández, Irene (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Leida, Carmen (Universitat Politècnica de València. Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Zouine, Mohammed (Centre National de la Recherche Scientifique. Université de Toulouse. Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gómez, María Dolores (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Tornero, Pablo (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Pérez Amador, Miguel Ángel (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Esteras, Cristina ; Picó, Belén (Universitat Politècnica de València. Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Romero, Carlos (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Monforte, Antonio J. (Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas)
Key message: The gene underlying the melon fruit shape QTL fsqs8. 1 is a member of the Ovate Family Proteins. Variation in fruit morphology is caused by changes in gene expression likely due to a cryptic structural variation in this locus. [...]
2021 - 10.1007/s00122-021-03998-6
Theoretical and Applied Genetics, (November 2021)  
4.
8 p, 813.1 KB Resynthesis : marker-based partial reconstruction of elite genotypes in clonally-reproducing plant species / Eduardo, Iban (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alegre, Simó (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Arús i Gorina, Pere (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We propose a method for marker-based selection of cultivars of clonally-reproducing plant species which keeps the basic genetic architecture of a top-performing cultivar (usually a partly heterozygous genotype), with the addition of some agronomically relevant differences (such as production time, product appearance or quality), providing added value to the product or cultivation process. [...]
2020 - 10.3389/fpls.2020.01205
Frontiers in plant science, Vol. 11 (August 2020) , art. 1205  
5.
23 p, 964.2 KB Fine mapping of the peach pollen sterility gene (Ps/ps) and detection of markers for marker-assisted selection / Eduardo, Iban (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Tomás, Carlos de (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Giovannini, Daniela (Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria. Centro di Ricerca per le Colture di Olive, Frutta e Agrumi (Italia)) ; Pietrella, M. (Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi dell'Economia Agraria. Centro di Ricerca per le Colture di Olive, Frutta e Agrumi (Italia)) ; Carpenedo, S. (Embrapa Clima Temperado (Brasil)) ; Bassols Raseira, M. C. (Embrapa Clima Temperado (Brasil)) ; Batlle, Ignasi (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Cantin, Celia M (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Parc Científic i Tecnològic Agroalimentari de Lleida) ; Aranzana, Maria José (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Arús i Gorina, Pere (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
In peach, pollen sterility, expressed as absence of pollen in the anthers, segregates as an undesired trait in breeding programs. Pollen fertility screening in progenies is not a common practice mainly because it does not affect fruit set since cross-pollination is frequent. [...]
2020 - 10.1007/s11032-020-01139-3
Molecular Breeding, Vol. 40, Issue 6 (June 2020) , art. 57  
6.
10 p, 1.6 MB Mapping Cucumber Vein Yellowing Virus Resistance in Cucumber (Cucumis sativus L.) by Using BSA-seq Analysis / Pujol Abajo, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fontaine, Anne-Sophie (Semillas Fitó S.A.) ; Mayor, Patricia (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura. Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal) ; Miras, Manuel (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura. Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal) ; Jahrmann, Torben (Semillas Fitó S.A.) ; Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Aranda, Miguel A. (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura. Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal)
Cucumber vein yellowing virus (CVYV) causes severe yield losses in cucurbit crops across Mediterranean countries. The control of this virus is based on cultural practices to prevent the presence of its vector (Bemisia tabaci) and breeding for natural resistance, which requires the identification of the loci involved and the development of molecular markers for linkage analysis. [...]
2019 - 10.3389/fpls.2019.01583
Frontiers in plant science, Vol. 10 (December 2019) , art. 1583  
7.
17 p, 3.0 MB QTL mapping of melon fruit quality traits using a high-density GBS-based genetic map / Pereira, Lara (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ruggieri, Valentino (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pérez, S. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fernández, Marta (Semillas Fitó, S.L) ; Jahrmann, Torben (Semillas Fitó, S.L.) ; Pujol Abajo, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Background: Melon shows a broad diversity in fruit morphology and quality, which is still underexploited in breeding programs. The knowledge of the genetic basis of fruit quality traits is important for identifying new alleles that may be introduced in elite material by highly efficient molecular breeding tools. [...]
2018 - 10.1186/s12870-018-1537-5
BMC plant biology, Vol. 18 (2018) , art. 324  
8.
50 p, 962.3 KB Transposons played a major role in the diversification between the closely related almond and peach genomes : Results from the almond genome sequence / Alioto, Tyler Scott (Centre de Regulació Genòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Bardil, Amélie (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Barteri, Fabio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Castanera, Raúl (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cruz, Fernando (Centre de Regulació Genòmica) ; Dhingra, Amit (Washington State University. Department of Horticulture) ; Duval, Henri (Institut National de la Recherche Agronomique (França)) ; Fernández i Martí, Angel (University of California) ; Frias, Leonor (Centre de Regulació Genòmica) ; Galán, Beatriz (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; García, José Luis (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Howad, Werner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gómez-Garrido, Jessica (Centre de Regulació Genòmica) ; Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ; Julca, Irene (Centre de Regulació Genòmica) ; Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ribeca, Paolo (Centre de Regulació Genòmica) ; Rubio Cabetas, María José (Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón) ; Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ; Wirthensohn, Michelle (The University of Adelaide. School of Agriculture, Food and Wine) ; Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Arús i Gorina, Pere (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We sequenced the genome of the highly heterozygous almond Prunus dulcis cv. Texas combining short and long-read sequencing. We obtained a genome assembly totaling 227. 6 Mb of the estimated 238 Mb almond genome size, of which 91% is anchored to eight pseudomolecules corresponding to its haploid chromosome complement, and annotated 27,969 protein-coding genes and 6,747 non-coding transcripts. [...]
2020 - 10.1111/tpj.14538
The Plant journal, Vol. 101, Issue 2 (January 2020) , p. 455-472  
9.
9 p, 1.8 MB An improved assembly and annotation of the melon (Cucumis melo L.) reference genome / Ruggieri, Valentino (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Argyris, Jason (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pujol Abajo, Marta (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Yano, Ryoichi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Nonaka, Satoko (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Ezura, Hiroshi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Latrasse, David (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Boualem, Adnane (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Benhamed, Moussa (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Bendahmane, Abdelhafid (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech SL) ; Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We report an improved assembly (v3. 6. 1) of the melon (Cucumis melo L. ) genome and a new genome annotation (v4. 0). The optical mapping approach allowed correcting the order and the orientation of 21 previous scaffolds and permitted to correctly define the gap-size extension along the 12 pseudomolecules. [...]
2018 - 10.1038/s41598-018-26416-2
Scientific reports, Vol. 8 (May 2018) , art. 8088  
10.
12 p, 836.9 KB The evolutionary consequences of transposon-related pericentromer expansion in melon / Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Tormo, Marc (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Vives, Cristina (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramos-Onsins, Sebastian (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Transposable elements (TEs) are a major driver of plant genome evolution. A part frombeing a rich source of new genes and regulatory sequences, TEs can also affect plant genome evolution by modifying genome size and shaping chromosome structure. [...]
2018 - 10.1093/gbe/evy115
Genome biology and evolution, Vol. 10, Núm. 6 (June 2018) , p. 1584-1595  

Depósito Digital de Documentos de la UAB : Encontrados 12 registros   1 - 10siguiente  ir al registro:
¿Le interesa recibir alertas sobre nuevos resultados de esta búsqueda?
Defina una alerta personal vía correo electrónico o subscríbase al canal RSS.