1.
|
|
2.
|
|
3.
|
|
4.
|
15 p, 2.7 MB |
Concordance between Antimicrobial Resistance Phenotype and Genotype of Staphylococcus pseudintermedius from Healthy Dogs
/
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Fábregas, Norma (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Pérez, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Fonticoba, Rocío (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Ferrer i Caubet, Lluís (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Staphylococcus pseudintermedius, a common commensal canine bacterium, is the main cause of skin infections in dogs and is a potential zoonotic pathogen. The emergence of methicillin-resistant S. pseudintermedius (MRSP) has compromised the treatment of infections caused by these bacteria. [...]
2022 - 10.3390/antibiotics11111625
Antibiotics, Vol. 11 (november 2022)
|
|
5.
|
4 p, 292.7 KB |
Whole-Genome Sequencing and De Novo Assembly of 67 Strains Isolated from the Skin of Healthy Dogs
/
Fábregas, Norma (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Pérez, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Fonticoba, Rocío (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Ferrer i Caubet, Lluís (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
We have de novo assembled 67 genomes, with median values of 2. 6 Mbp size and 99. 43% completeness, 2,386 coding sequences, 19 complete rRNAs, 59 tRNAs, and 4 noncoding RNAs. We released 51 single-contig complete genomes and 16 genomes with a circular main contig using Nanopore sequencing.
2022 - 10.1128/mra.00039-22
Microbiology Resource Announcements, Vol. 11 (march 2022)
|
|
6.
|
|
7.
|
10 p, 4.4 MB |
Whole genome sequencing and de novo assembly of Staphylococcus pseudintermedius : a pangenome approach to unravelling pathogenesis of canine pyoderma
/
Ferrer i Caubet, Lluís (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
García Fonticoba, Rocío (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Pérez, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Fábregas, Norma (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Madroñero Mateus, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Meroni, Gabriele (Surgical and Dental Sciences - One Health Unit. Department of Biomedical) ;
Martino, Piera A. (Surgical and Dental Sciences - One Health Unit. Department of Biomedical) ;
Martínez, Sofia (Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Grupo de Medicina Veterinaria Traslacional) ;
Maté, M. Laura (Universidad Nacional del Centro. Laboratorio de Farmacología. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil) ;
Sánchez-Bruni, Sergio (Universidad Nacional del Centro. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
Background: Staphylococcus pseudintermedius is the main aetiological agent of canine pyoderma. Whole genome sequencing is the most comprehensive way of obtaining relevant genomic information about micro-organisms. [...]
2021 - 10.1111/vde.13040
Veterinary Dermatology, Vol. 32, Issue 6 (November 2021) , p. 654-663
|
|
8.
|
4 p, 347.3 KB |
Whole-Genome Sequencing and De Novo Assembly of 61 Isolates from Healthy Dogs and Dogs with Pyoderma
/
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Pérez, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Fonticoba, Rocío (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Madroñero Mateus, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ;
Meroni, Gabriele (Surgical and Dental Sciences - One Health Unit. Department of Biomedical) ;
Martino, Piera A. (Surgical and Dental Sciences - One Health Unit. Department of Biomedical) ;
Martínez, Sofia (Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias) ;
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Fábregas, Norma (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ;
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Ferrer i Caubet, Lluís (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals)
We have de novo assembled and polished 61 genome sequences with Nanopore-only long reads. Completeness was 99. 25%. The average genome size was 2. 70 Mbp, comprising 2,506 coding sequences, 19 complete rRNAs, 56 to 59 tRNAs, and 4 noncoding RNAs (ncRNAs), as well as CRISPR arrays. [...]
2021 - 10.1128/MRA.00152-21
Microbiology Resource Announcements, Vol. 10 (april 2021)
|
|
9.
|
13 p, 3.4 MB |
Overexpression of the vascular brassinosteroid receptor BRL3 confers drought resistance without penalizing plant growth
/
Fábregas, Norma (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Lozano Elena, Fidel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Blasco Escámez, David (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Tohge, Takayuki (NAIST Graduate school of Biological Sciences) ;
Martínez Andújar, Cristina (CEBAS-CSIC) ;
Albacete, Alfonso (CEBAS-CSIC) ;
Osorio, Sonia (Universidad de Málaga) ;
Bustamante Montoya, Mariana (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Riechmann, José Luis (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Nomura, Takahito (Utsunomiya University) ;
Yokota, Takao (Teikyo University) ;
Conesa, Ana (University of Florida) ;
Pérez Alfocea, Francisco (CEBAS-CSIC) ;
Fernie, Alisdair (Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology) ;
Caño Delgado, Ana I. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Drought represents a major threat to food security. Mechanistic data describing plant responses to drought have been studied extensively and genes conferring drought resistance have been introduced into crop plants. [...]
2018 - 10.1038/s41467-018-06861-3
Nature communications, Vol. 9 (November 2018) , art. 4680
|
|
10.
|
10 p, 6.5 MB |
TOPLESS mediates brassinosteroid control of shoot boundaries and root meristem development in Arabidopsis thaliana
/
Espinosa-Ruiz, Ana (Centro Nacional de Biotecnología. Departamento de Genética Molecular de Plantas) ;
Martínez, Cristina (Centro Nacional de Biotecnología. Departamento de Genética Molecular de Plantas) ;
Lucas, Miguel de (Centro Nacional de Biotecnología. Departamento de Genética Molecular de Plantas) ;
Fábregas, Norma (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Bosch, Nadja (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Caño Delgado, Ana I. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Prat, Salomé (Centro Nacional de Biotecnología. Departamento de Genética Molecular de Plantas)
The transcription factor BRI1-EMS-SUPRESSOR 1 (BES1) is a master regulator of brassinosteroid (BR)-regulated gene expression. BES1 together with BRASSINAZOLE-RESISTANT 1 (BZR1) drive activated or repressed expression of several genes, and have a prominent role in negative regulation of BR synthesis. [...]
2017 - 10.1242/dev.143214
Development (Cambridge), Vol. 144 Issue 9 (May 2017) , p. 1619-1628
|
|