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1.
6 p, 665.3 KB Can bioinformatics help in the identification of moonlighting proteins? / Hernández, Sergio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Calvo, Alejandra (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Ferragut, Gabriela (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Franco Serrano, Luis (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Hermoso, Antoni (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Amela Abellan, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Gómez, Antonio (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología)
Protein multitasking or moonlighting is the capability of certain proteins to execute two or more unique biological functions. This ability to perform moonlighting functions helps us to understand one of the ways used by cells to perform many complex functions with a limited number of genes. [...]
2014 - 10.1042/BST20140241
Biochemical Society Transactions, Vol. 42, issue 6 (Dec. 2014) , p. 1692-1697  
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2.
16 p, 3.2 MB Bioinformatics and moonlighting proteins / Hernández, Sergio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Franco Serrano, Luis (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Calvo, Alejandra (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Ferragut, Gabriela (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Hermoso, Antoni (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Amela Abellan, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Gómez, Antonio (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología)
Multitasking or moonlighting is the capability of some proteins to execute two or more biochemical functions. Usually, moonlighting proteins are experimentally revealed by serendipity. For this reason, it would be helpful that Bioinformatics could predict this multifunctionality, especially because of the large amounts of sequences from genome projects. [...]
2015 - 10.3389/fbioe.2015.00090
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Vol. 3 (June 2015) , art. 90  
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3.
14 p, 810.6 KB Including Functional Annotations and Extending the Collection of Structural Classifications of Protein Loops (ArchDB) / Hermoso, Antoni (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Espadaler Mazo, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Enrique Querol, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Avilés, Francesc X. (Francesc Xavier) (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Sternberg, Michael J. E. (Imperial College. Department of Biological Sciences. Structural Bioinformatics Group) ; Oliva Miguel, Baldomero (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Fernández-Fuentes, Narcís (St. James University Hospital. Leeds Institute of Molecular Medicine)
Loops represent an important part of protein structures. The study of loop is critical for two main reasons: First, loops are often involved in protein function, stability and folding. Second, despite improvements in experimental and computational structure prediction methods, modeling the conformation of loops remains problematic. [...]
2007
Bioinformatics and biology insights, Vol. 1 (January 2007) , p. 77-90  
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4.
5 p, 2.6 MB PRGdb 2.0 : towards a community-based database model for the analysis of R-genes in plants / Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Hermoso, Antoni (Centre de Regulació Genòmica) ; D'Alessandro, Raffaella (Università degli Studi di Napoli Federico II) ; Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ; Andolfo, Giuseppe (Università degli Studi di Napoli Federico II) ; Frusciante, Luigi (Università degli Studi di Napoli Federico II) ; Lowy, Ernesto (Centre de Regulació Genòmica) ; Roma, Guglielmo (Centre de Regulació Genòmica) ; Ercolano, Maria Raffaella (Università degli Studi di Napoli Federico II)
The Plant Resistance Genes database (PRGdb; http://prgdb. org) is a comprehensive resource on resistance genes (R-genes), a major class of genes in plant genomes that convey disease resistance against pathogens. [...]
2013 - 10.1093/nar/gks1183
Nucleic acids research, Vol. 41 (2013) , p. D1167-D1171  
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