|
1.
|
|
11 p, 1.1 MB |
Y chromosome sequence and epigenomic reconstruction across human populations
/
Esteller-Cucala, Paula (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Palmada-Flores, Marc (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Kuderna, Lukas F. K. (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Fontsere, Claudia (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Serres-Armero, Aitor (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Dabad, Marc (Centre de Regulació Genòmica) ;
Torralvo, María (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Faella, Armida (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Ferrández-Peral, Luis (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Llovera, Laia (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Julià, Eva (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ramírez, Erika (Centre de Regulació Genòmica) ;
González, Irene (Centre de Regulació Genòmica) ;
Hecht, Jochen (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lizano, Esther (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont) ;
Juan, David (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Marques-Bonet, Tomas 1975- (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont)
Recent advances in long-read sequencing technologies have allowed the generation and curation of more complete genome assemblies, enabling the analysis of traditionally neglected chromosomes, such as the human Y chromosome (chrY). [...]
2023 -  10.1038/s42003-023-05004-9
Communications Biology, Vol. 6 (June 2023) , art. 623
|
|
|
2.
|
|
16 p, 5.0 MB |
Transcriptome innovations in primates revealed by single-molecule long-read sequencing
/
Ferrández-Peral, Luis (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Zhan, Xiaoyu (BGI-Shenzhen) ;
Alvarez-Estape, Marina (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Chiva, Cristina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Esteller-Cucala, Paula (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
García Perez, Raquel (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Julià, Eva (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lizano, Esther (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Sabidó, Eduard (Centre de Regulació Genòmica) ;
Li, Qiye (BGI-Shenzhen) ;
Marques-Bonet, Tomas 1975- (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont) ;
Juan, David (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Zhang, Guojie
Transcriptomic diversity greatly contributes to the fundamentals of disease, lineage-specific biology, and environmental adaptation. However, much of the actual isoform repertoire contributing to shaping primate evolution remains unknown. [...]
2022 - 10.1101/gr.276395.121
Genome research, Published in Advance July 15, 2022
2 documents
|
|
|
3.
|
|
26 p, 7.4 MB |
Three-dimensional genomic structure and cohesin occupancy correlate with transcriptional activity during spermatogenesis
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Salvà Castro, Judith (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gomez Hernández, Laura (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martín Pendas, Alberto (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica) ;
Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ;
Martí Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Mammalian gametogenesis involves dramatic and tightly regulated chromatin remodeling, whose regulatory pathways remain largely unexplored. Here, we generate a comprehensive high-resolution structural and functional atlas of mouse spermatogenesis by combining in situ chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), RNA sequencing (RNA-seq), and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) of CCCTC-binding factor (CTCF) and meiotic cohesins, coupled with confocal and super-resolution microscopy. [...]
2019 - 10.1016/j.celrep.2019.06.037
Cell reports, Vol. 28, issue 2 (Jul. 2019) , p. 352-367
|
|
|
4.
|
|
6 p, 757.8 KB |
Flow sorting enrichment and nanopore sequencing of chromosome 1 from a Chinese individual
/
Kuderna, Lukas (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Solís Moruno, Manuel (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut) ;
Batlle-Masó, Laura (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut) ;
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Lizano, Esther (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Anglada, Roger (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut) ;
Ramírez, Erika (Centre de Regulació Genòmica) ;
Bote, Alex (Centre de Regulació Genòmica) ;
Tormo, Marc (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut) ;
Marques-Bonet, Tomas 1975- (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont) ;
Fornas, Òscar (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut) ;
Casals, Ferran (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut)
Sorting of individual chromosomes by Flow Cytometry (flow-sorting) is an enrichment method to potentially simplify genome assembly by isolating chromosomes from the context of the genome. We have recently developed a workflow to sequence native, unamplified DNA and applied it to the smallest human chromosome, the Y chromosome. [...]
2020 - 10.3389/fgene.2019.01315
Frontiers in genetics, Vol. 10 (January 2020) , art. 1315
|
|
|
5.
|
|
8 p, 1.1 MB |
Selective single molecule sequencing and assembly of a human Y chromosome of African origin
/
Kuderna, Lukas (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Lizano, Esther (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Gómez-Garrido, Jessica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Serres-Armero, Aitor (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Kuhlwilm, Martin (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Antoni Alandes, Regina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Alvarez-Estape, Marina (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Juan, David (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Heath, Simon (Centre de Regulació Genòmica) ;
Alioto, Tyler Scott (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gut, Ivo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Heide Schierup, Mikkel (Aarhus University. Bioinformatics Research Center) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marques-Bonet, Tomas, 1975- (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont)
Mammalian Y chromosomes are often neglected from genomic analysis. Due to their inherent assembly difficulties, high repeat content, and large ampliconic regions, only a handful of species have their Y chromosome properly characterized. [...]
2019 - 10.1038/s41467-018-07885-5
Nature communications, Vol. 10 (January 2019) , art. 4
|
|
|
6.
|
|
|
7.
|
|
14 p, 99.4 KB |
Crítica a les teories migratòries des de la perspectiva de gènere
/
Jiménez Julià, Eva
En primer lloc, en aquest article es realitza una crítica, des de la perspectiva de gènere, a les principals teories migratòries fins a la dècada de 1970. Aquest tall ha estat introduït perquè, a partir d'aquesta data, comença a quedar reflectit el feminisme en les ciències socials. [...]
En primer lugar, se realiza una crítica, desde la perspectiva de género, a las principales teorías migratorias hasta la década de 1970. Este corte se ha introducido porque, a partir de esta fecha, empieza a quedar reflejado el feminismo en las ciencias sociales. [...]
D'abord et depuis une perspective de genre on analyse les principales théories des migrations élaborées dès le début des années 1970. C'est une appréciation introduite pour tenir compte du fait qu'à partir de là l'influence du féminisme commence a se manifester dans les sciences sociales. [...]
In the first place, this article evaluates the most important migration theories proposed up until the 1970's from a gender perspective. This chronological break is introduced because thereafter, the social sciences start to reflect the influence of feminism. [...]
1998
Documents d'anàlisi geogràfica, N. 33 (1998) , p. 189-202
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
