Results overview: Found 13 records in 0.02 seconds.
Articles, 9 records found
Research literature, 4 records found
Articles 9 records found  
1.
10 p, 1.4 MB Brain metabolic pattern analysis using a magnetic resonance spectra classification software in experimental stroke / Jiménez Xarrié, Elena (Institut d'Investigació Biomèdica de Sant Pau. Unitat de Malalties Vasculars Cerebrals) ; Dávila Huerta, Myriam (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Candiota Silveira, Ana Paula (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Delgado-Mederos, Raquel (Institut d'Investigació Biomèdica de Sant Pau. Unitat de Malalties Vasculars Cerebrals) ; Ortega-Martorell, Sandra (Liverpool John Moores University. Department of Applied Mathematics) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Martí-Fàbregas, Joan (Institut d'Investigació Biomèdica de Sant Pau. Unitat de Malalties Vasculars Cerebrals)
Magnetic resonance spectroscopy (MRS) provides non-invasive information about the metabolic pattern of the brain parenchyma in vivo. The SpectraClassifier software performs MRS pattern-recognition by determining the spectral features (metabolites) which can be used objectively to classify spectra. [...]
2017 - 10.1186/s12868-016-0328-x
BMC Neuroscience, Vol. 18, issue 1 (Jan. 2017) , art. 13  
2.
29 p, 14.8 MB Metabolomics of Therapy Response in Preclinical Glioblastoma : a Multi-Slice MRSI-Based Volumetric Analysis for Noninvasive Assessment of Temozolomide Treatment / Arias-Ramos, Nuria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Ferrer-Font, Laura (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Lope Piedrafita, Silvia (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Ressonància Magnètica Nuclear) ; Mocioiu, Victor (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Pumarola i Batlle, Martí (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Candiota Silveira, Ana Paula (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular)
Glioblastoma (GBM) is the most common aggressive primary brain tumor in adults, with a short survival time even after aggressive therapy. Non-invasive surrogate biomarkers of therapy response may be relevant for improving patient survival. [...]
2017 - 10.3390/metabo7020020
Metabolites, Vol. 7, Num. 2 (2017) , p. p1-29  
3.
16 p, 1.3 MB Strategies for annotation and curation of translational databases: the eTUMOUR project / Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Lurgi Rivera, Miguel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Mier, Mariola (Pharma Quality Europe (PQE) (Itàlia)) ; Estanyol, Francesc (Microart SL (Barcelona)) ; Rafael, Xavier (Microart SL (Barcelona)) ; Candiota Silveira, Ana Paula (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Barceló Vernet, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Torres Garcia, Alina (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Martínez Bisbal, M. Carmen (Universidad de València. Departament de Química Física) ; Ferrer Luna, Rubén (Universidad de València. Departament de Química Física) ; Moreno Torres, Àngel (Centro de Investigación Biomédica en Red en Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina (CIBER-BBN)) ; Celda Muñoz, Bernardo (Universidad de València. Departament de Química Física) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular)
The eTUMOUR (eT) multi-centre project gathered in vivo and ex vivo magnetic resonance (MR) data, as well as transcriptomic and clinical information from brain tumour patients, with the purpose of improving the diagnostic and prognostic evaluation of future patients. [...]
2012 - 10.1093/database/bas035
Database (Oxford), Vol. 2012, Num. bas035 (2012) , p. 1-6  
4.
11 p, 2.4 MB From raw data to data-analysis for magnetic resonance spectroscopy – the missing link : jMRUI2XML / Mocioiu, Victor (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Ortega-Martorell, Sandra (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics) ; Olier, Iván (University of Manchester. Institute of Population Health) ; Jablonski, Michal (Institute of Scientific Instruments of the CAS (Brno, República Txeca)) ; Starcukova, Jana (Institute of Scientific Instruments of the CAS (Brno, República Txeca)) ; Lisboa, Paulo J. G. (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Background: Magnetic resonance spectroscopy provides metabolic information about living tissues in a non-invasive way. However, there are only few multi-centre clinical studies, mostly performed on a single scanner model or data format, as there is no flexible way of documenting and exchanging processed magnetic resonance spectroscopy data in digital format. [...]
2015 - 10.1186/s12859-015-0796-5
BMC Bioinformatics, Vol. 16, N. 378 (November 2015) , p. 1-11  
5.
14 p, 1.1 MB A Novel Semi-Supervised Methodology for Extracting Tumor Type-Specific MRS Sources in Human Brain Data / Ortega-Martorell, Sandra (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics) ; Ruiz, Héctor (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics) ; Vellido, Alfredo (Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Llenguatges i Sistemes Informàtics) ; Olier, Iván (University of Manchester. Institute of Population Health) ; Romero, Enrique (Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Llenguatges i Sistemes Informàtics) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Centro de Investigación Biomédica en Red en Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina (CIBER-BBN)) ; Martín, José D. (Universidad de Valencia. Departamento de Ingeniería Electrónica.) ; Jarman, Ian H. (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Lisboa, Paulo J. G. (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics)
Background: the clinical investigation of human brain tumors often starts with a non-invasive imaging study, providing information about the tumor extent and location, but little insight into the biochemistry of the analyzed tissue. [...]
2013 - 10.1371/journal.pone.0083773
PLoS one, Vol. 8 Issue 12 (December 2013) , p. e83773  
6.
20 p, 570.3 KB Non-negative matrix factorisation methods for the spectral decomposition of MRS data from human brain tumours / Ortega-Martorell, Sandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Lisboa, Paulo J. G. (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics) ; Vellido, Alfredo (Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Llenguatges i Sistemes Informàtics) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Background: In-vivo single voxel proton magnetic resonance spectroscopy (SV 1H-MRS), coupled with supervised pattern recognition (PR) methods, has been widely used in clinical studies of discrimination of brain tumour types and follow-up of patients bearing abnormal brain masses. [...]
2012 - 10.1186/1471-2105-13-38
BMC Bioinformatics, Vol. 13, N. 38 (March 2012) , p. 1-20  
7.
12 p, 816.6 KB The INTERPRET Decision-Support System version 3.0 for evaluation of Magnetic Resonance Spectroscopy data from human brain tumours and other abnormal brain masses / Pérez Ruiz, Alexander (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Mercadal, Guillem (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Olier, Iván (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Neurociències) ; Majós, Carles (Institut de Diagnòstic per la Imatge) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Background: Proton Magnetic Resonance (MR) Spectroscopy (MRS) is a widely available technique for those clinical centres equipped with MR scanners. Unlike the rest of MR-based techniques, MRS yields not images but spectra of metabolites in the tissues. [...]
2010 - 10.1186/1471-2105-11-581
BMC Bioinformatics, Vol. 11 N. 581 (November 2010) , p. 1-12  
8.
14 p, 1.6 MB SpectraClassifier 1.0 : a user friendly, automated MRS-based classifier-development system / Ortega-Martorell, Sandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Olier, Iván (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Neurociències) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Background: SpectraClassifier (SC) is a Java solution for designing and implementing Magnetic Resonance Spectroscopy (MRS)-based classifiers. The main goal of SC is to allow users with minimum background knowledge of multivariate statistics to perform a fully automated pattern recognition analysis. [...]
2010 - 10.1186/1471-2105-11-106
BMC Bioinformatics, Vol. 11, N. 106 (February 2010) , p. 1-14  
9.
17 p, 1.5 MB Convex non-negative matrix factorization for brain tumor delimitation from MRSI data. / Ortega-Martorell, Sandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Lisboa, P. J. G. (Liverpool John Moores University. Department of Mathematics and Statistics) ; Vellido, Alfredo (Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Llenguatges i Sistemes Informàtics) ; Simões, Rui V. (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (Nova York, Estats Units d'Amèrica). Department of Medical Physics) ; Pumarola i Batlle, Martí (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular)
Background: Pattern Recognition techniques can provide invaluable insights in the field of neuro-oncology. This is because the clinical analysis of brain tumors requires the use of non-invasive methods that generate complex data in electronic format. [...]
2012 - 10.1371/journal.pone.0047824
PLoS one, Vol. 7, Issue 10 (October 2012) , p. e47824  

Research literature 4 records found  
1.
1 p, 172.6 KB MRI-MRSI-GL261 mice / Ortega-Martorell, Sandra (Liverpool John Moores University. Department of Applied Mathematics) ; Candiota Silveira, Ana Paula (Centro de Investigación Biomédica en Red en Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina (CIBER-BBN)) ; Thomson, Ryan (Liverpool John Moores University. Department of Applied Mathematics) ; Julià Sapé, Ma. Margarita (Centro de Investigación Biomédica en Red en Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina (CIBER-BBN)) ; Olier, Ivan (Liverpool John Moores University. Department of Applied Mathematics) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
MRI/MRSI data from GL261 tumor-bearing mice, from Bruker vendor.
Universitat Autònoma de Barcelona 2017 - 10.5565/ddd.uab.cat/201551
2 documents
2.
206 p, 3.4 MB Contribución al fenotipado molecular de tumores cerebrales preclínicos mediante estudios in vitro e in vivo / Martín Sitjar de Togores, Juana ; Arús i Caraltó, Carles, dir. ; Julià Sapé, Ma. Margarita, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
Los tumores del sistema nervioso central (SNC) abarcan menos de un 2 % del total de casos de cáncer diagnosticados cada año a nivel mundial (aproximadamente 175. 000) representado entre 0,4 y 25,4 de casos por 100. [...]
Central nervous system tumors (CNS) represent less than 2% of all cases of cancer diagnosed each year worldwide (approximately 175,000), which means between 0. 4 and 25. 4 cases per 100,000 adults. Despite this, they constitute an important source of mortality and disability. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2014  
3.
38 p, 977.1 KB Comparativa de dues eines de software pel desenvolupament de classificadors d'espectroscòpia de ressonància magnètica nuclear de tumors cerebrals humans / Ferrer Pueyo, Silvia ; Julià Sapé, Ma. Margarita ; Arús i Caraltó, Carles ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
En aquest treball s'ha fet una avaluació comparativa dels resultats que es poden obtenir amb el software SpectraClassifier 1. 0 (SC) desenvolupat al nostre grup de recerca, comparant-lo amb l'SPSS, un programa estadístic informàtic estàndard, en un problema de classificació de tumors cerebrals humans amb dades d'espectroscòpia de ressonància magnètica de protó (1H‐ERM). [...]
2010  
4.
102 p, 1.2 MB Millora de la diagnosi no invasiva dels tumors cerebrals humans / Julià Sapé, Ma. Margarita ; Arús i Caraltó, Carles, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular)
Propòsit: Millorar la caracterització no invasiva dels tumors cerebrals mitjançant la tècnica de l'espectroscopia de ressonància magnètica de protó. Per a assolir aquest objectiu, es van realitzar tres estudis, amb els següents objectius: Estudi 1) Generar una base de dades accessible per Internet, que contingui dades clíniques i espectroscòpiques completament validades de pacients afectats per tumors cerebrals. [...]
Purpose: To improve the non-invasive characterisation of brain tumours with 1H-MRS (proton magnetic resonance spectroscopy). For this, three studies were performed, with the following objectives: 1) To generate an Internet-accessible database that contains validated in-vivo MR spectra and clinical data of brain tumour patients. [...]

Bellaterra : Universitat Autònoma de Barcelona, 2007  

Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.