|
1.
|
|
8 p, 1.2 MB |
Single and longitudinal genome-wide association studies for dairy traits available in goats with three recorded lactations
/
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Martínez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Macri, Martina (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Delgado, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Fernández Alvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina) ;
Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Milk yield and composition phenotypes are systematically recorded across several lactations in goats, but the majority of genome-wide association studies (GWAS) performed so far have rather ignored the longitudinal nature of such data. [...]
2024 -  10.1111/age.13391
Animal Genetics, Vol. 55, Núm. 2 (April 2024) , p. 257-264
|
|
|
2.
|
|
16 p, 2.1 MB |
A protein-coding gene expression atlas from the brain of pregnant and non-pregnant goats
/
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
López Béjar, Manel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ;
Casas Díaz, Encarna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Olvera-Maneu, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ;
Gardela Santacruz, Jaume (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ;
Palomo Peiró, María Jesús (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Osuagwuh, Uchebuchi Ike (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Ohaneje, Uchechi Linda (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Background: The brain is an extraordinarily complex organ with multiple anatomical structures involved in highly specialized functions related with behavior and physiological homeostasis. Our goal was to build an atlas of protein-coding gene expression in the goat brain by sequencing the transcriptomes of 12 brain regions in seven female Murciano-Granadina goats, from which three of them were 1-month pregnant. [...]
2023 - 10.3389/fgene.2023.1114749
Frontiers in genetics, Vol. 14 (july 2023)
|
|
|
3.
|
|
17 p, 2.4 MB |
Evolution of inbreeding : a gaze into five Italian beef cattle breeds history
/
Rovelli, Giacomo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Sbarra, Fiorella (National Association of Italian Beef-Cattle Breeders) ;
Quaglia, Andrea (National Association of Italian Beef-Cattle Breeders) ;
Sarti, Francesca Maria (University of Perugia. Department of Agricultural, Food and Environmental Sciences) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Lasagna, Emiliano (University of Perugia. Department of Agricultural, Food and Environmental Sciences)
In the last decades, intensive selection programs have led to sustained increases of inbreeding in dairy cattle, a feature that might have adverse consequences on the viability and phenotypic performance of their offspring. [...]
2021 - 10.7717/peerj.12049
PeerJ, Vol. 9 (september 2021)
|
|
|
4.
|
|
17 p, 1.5 MB |
Assessing the levels of intraspecific admixture and interspecific hybridization in Iberian wild goats (Capra pyrenaica)
/
Cardoso, Tainã Figueiredo (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Luigi Sierra, Maria Gracia (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Castelló Farré, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Noce, Antonia (Leibniz-Institute for Farm Animal Biology) ;
Mármol-Sánchez, Emilio (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
García-González, Ricardo (Instituto Pirenaico de Ecología) ;
Fernández-Arias, Alberto (Gobierno de Aragón) ;
Alabart, José Luis (Gobierno de Aragón) ;
López Olvera, Jorge R (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei d'Ecopatologia de Fauna Salvatge) ;
Mentaberre García, Gregorio (Universitat de Lleida. Departament de Ciència Animal) ;
Granados Torres, José Enrique (Espacio Natural Sierra Nevada) ;
Cardells-Peris, Jesús (Universidad CEU Cardenal Herrera) ;
Molina, Antonio (Universidad de Córdoba) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Iberian wild goats (Capra pyrenaica, also known as Iberian ibex, Spanish ibex, and Spanish wild goat) underwent strong genetic bottlenecks during the 19 th and 20 th centuries due to overhunting and habitat destruction. [...]
2021 - 10.1111/eva.13299
Evolutionary applications, Vol. 14 (september 2021) , p. 2618-2634
|
|
|
5.
|
|
14 p, 3.2 MB |
Genomic patterns of homozygosity and inbreeding depression in Murciano-Granadina goats
/
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Fernández, Almudena (INIA. Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Fernández Álvarez, Javier (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Landi, Vincenzo (University of Bari ''Aldo Moro". Department of Veterinary Medicine) ;
Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Saura, María (INIA. Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Inbreeding depression can adversely affect traits related to fitness, reproduction and productive performance. Although current research suggests that inbreeding levels are generally low in most goat breeds, the impact of inbreeding depression on phenotypes of economic interest has only been investigated in a few studies based on genealogical data. [...]
2022 - 10.1186/s40104-022-00684-5
Journal of animal science and biotechnology, Vol. 13 (March 2022) , art. 35
|
|
|
6.
|
|
9 p, 3.2 MB |
An association analysis between a polymorphism in the SEC24A gene and lipid traits recorded in Duroc pigs
/
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
By regulating the expression of low-density lipoprotein receptors (LDLR), the SEC24A protein modulates the clearance of plasma cholesterol in mice. The whole-genome sequencing of five Duroc boars that sired a Duroc purebred experimental population (LIPGEN population, 350 individuals) revealed the segregation of one putative nonsense mutation located at the SEC24A (rs336401826, c. [...]
2021 - 10.1080/1828051X.2021.1951129
Italian journal of animal science, Vol. 20, Issue 1 (October 2021) , p. 1444-1451
|
|
|
7.
|
|
21 p, 2.2 MB |
Variability in porcine microRNA genes and its association with mRNA expression and lipid phenotypes
/
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Castelló Farré, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Quintanilla, Raquel (Institute for Research and Technology in Food and Agriculture. Animal Breeding and Genetics Program) ;
Tonda, Raul (Centre de Regulació Genòmica) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Mature microRNAs (miRNAs) play an important role in repressing the expression of a wide range of mRNAs. The presence of polymorphic sites in miRNA genes and their corresponding 3'UTR binding sites can disrupt canonical conserved miRNA-mRNA pairings, and thus modify gene expression patterns. [...]
2021 - 10.1186/s12711-021-00632-3
Genetics, selection, evolution, Vol. 53 (May 2021) , art. 43
|
|
|
8.
|
|
16 p, 3.7 MB |
Genetic Diversity of Bubalus bubalis in Germany and Global Relations of Its Genetic Background
/
Noce, Antonia (Leibniz-Institute for Farm Animal Biology) ;
Qanbari, Saber (Leibniz-Institute for Farm Animal Biology) ;
González Prendes, Rayner (Wageningen University & Research. Animal Breeding and Genomics) ;
Brenmoehl, Julia (Leibniz-Institute for Farm Animal Biology) ;
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Theerkorn, Michael (Hof am Meer GmBH) ;
Fiege, Marc-André (Gut Darss, GmbH & Co. KG) ;
Pilz, Heike (Wiesenburger Land eG) ;
Bota, Adrian (Research and Development Station for Buffalos Şercaia) ;
Vidu, Livia (University of Agronomic Sciences and Veterinary Medicine of Bucharest) ;
Horwath, Csaba (Comuna Baciu sat Mera) ;
Haraszthy, László (Pro Vértes) ;
Penchev, Pencho (Bulgarian National Association for Development of Buffalo Breeding) ;
Ilieva, Yordanka (Bulgarian National Association for Development of Buffalo Breeding) ;
Peeva, Tzonka (Bulgarian National Association for Development of Buffalo Breeding) ;
Lüpcke, Wolfgang (Agricultural University Plovdiv. Higher School in Agribusiness and Development of Regions) ;
Krawczynski, René (Energiequelle GmbH) ;
Wimmers, Klaus (Leibniz-Institute for Farm Animal Biology) ;
Thiele, Manfred (German Buffalo Association) ;
Hoeflich, Andreas (Leibniz-Institute for Farm Animal Biology)
This is the first study to explore the genetic diversity and population structure of domestic water buffalo (Bubalus bubalis) in Germany and their potential relations to herds in other parts of Europe or worldwide. [...]
2021 - 10.3389/fgene.2020.610353
Frontiers in genetics, Vol. 11 (January 2021) , art. 610353
|
|
|
9.
|
|
14 p, 663.5 KB |
Markers with low GenTrain scores can generate spurious signals in genome-wide scans for transmission ratio distortion
/
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Fernández Álvarez, Javier (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Transmission ratio distortion (TRD) is the preferential transmission of one specific allele to offspring at the expense of the other. The existence of TRD is mostly explained by the segregation of genetic variants with deleterious effects on the developmental processes that go from the formation of gametes to fecundation and birth. [...]
2021 - 10.1111/age.13107
Animal Genetics, Vol. 52, Issue 5 (October 2021) , p. 779-781
|
|
|
10.
|
|
11 p, 1.0 MB |
Detecting the footprint of selection on the genomes of Murciano-Granadina goats
/
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Landi, Vincenzo (University of Bari "Aldo Moro") ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Fernández Álvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina) ;
Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Artificial selection is one of the major forces modifying the genetic composition of livestock populations. Identifying genes under selection could be useful to elucidate their impact on phenotypic variation. [...]
2021 - 10.1111/age.13113
Animal Genetics
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
