Per citar aquest document: http://ddd.uab.cat/record/69775
Bioinformática : identificar genes en una interfaz gráfica vía web para la comparación de genomas
Babitsch Soler, Ivan
Gonzàlez i Sabaté, Jordi
Huerta, Mario
Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria

Data: 2010
Descripció: 66 p.
Resum: Este trabajo desarrolla el proceso de diseño e implementación de una interfaz web que permite la exploración en detalle de las relaciones entre genomas completos. La interfaz permite la comparación simultánea de nueve genomas, representando en cada gráfica las relaciones entre cada par de genomas junto los genes identificados de cada uno de ellos. Es capaz de trabajar con genomas del dominio Eukaryota y se adapta a la capacidad de cómputo de la máquina cliente. La información representada son MUMs (Maximal Unique Matching, secuencia máxima y única encontrada en ambos genomas) y SuperMUMs (agrupación de MUMs mediante Approximate String Matching). Los datos son previamente calculados y accesibles desde un servidor web.
Resum: Aquest treball desenvolupa el procés de disseny i implementació d'una interfície web que permet l'exploració detallada de les relacions entre genomes complets. La interfície permet la comparació simultània de nou genomes, representant en cada gràfica les relacions entre cada parell de genomes junt els gens identificats de cadascun d'ells. És capaç de treballar amb genomes del domini Eukaryota i s'adapta a la capacitat de còmput de la màquina client. La informació representada són MUMs (Maximal Unique Matching, seqüència màxima i única trobada en tots dos genomes) i SuperMUMs (agrupació de MUMs mitjançant Approximate String Matching). Les dades són prèviament calculades i accessibles des d'un servidor web.
Resum: This work develops the process of designing and implementing a web interface that allows detailed examination of the relationship between complete genomes. The interface allows simultaneous comparison of nine genomes, each graph is representing the relationships between each pair of genomes with the genes identified for each of them. Able to work with domain Eukaryote genomes and adapts to the computing capacity of the client machine. The information represented are MUMs (Unique Maximal Matching, maximum and unique sequence found in both genomes) and SuperMUMs (MUMs grouping by Approximate String Matching). The data is pre-calculated and accessible from a web server.
Drets: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús de Creative Commons, amb la qual es permet copiar, distribuir i comunicar públicament l'obra sempre que se'n citin l'autor original, la universitat i l'escola i no se'n faci cap ús comercial ni obra derivada, tal com queda estipulat en la llicència d'ús Creative Commons
Llengua: Castellà.
Document: bachelorThesis
Matèria: Biologia computacional -- Mètodes ; Genètica -- Processament de dades

Adreça alternativa: http://hdl.handle.net/2072/114651


66 p, 2.9 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Treballs de recerca i projectes de final de carrera > Enginyeria. Projectes de final de carrera > Enginyeria Informàtica. PFC

 Registre creat el 2011-04-04, darrera modificació el 2016-06-11



   Favorit i Compartir