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Artículos, Encontrados 3 registros
Documentos de investigación, Encontrados 1 registros
Artículos Encontrados 3 registros  
1.
3 p, 352.7 KB Whole-Genome Sequencing and De Novo Assembly of Isolated from the Ear Canal of a Dog with Otitis / D'Andreano, Sara (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ; Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ; Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
We have de novo assembled the genome sequence of isolated from a canine otitis sample with Nanopore-only long reads. With 99× coverage and 8. 23 Mbp, the genome sequence was assembled in 10 contigs, with 6 of them corresponding to chromosomes, improving the scaffolding of previous genome assemblies for the species.
2021 - 10.1128/MRA.00205-21
Microbiology Resource Announcements, Vol. 10 (may 2021)  
Registro completo - Creative Commons
2.
20 p, 9.0 MB The microbiota of water buffalo milk during mastitis / Catozzi, Carlotta (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria) ; Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ; Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM)) ; Lecchi, Cristina (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria) ; De Carlo, Esterina (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ; Vecchio, Domenico (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ; Martucciello, Alessandra (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ; Fraulo, Pasquale (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno. National Reference Centre for Hygiene and Technologies of Water Buffalo Farming and Productions) ; Bronzo, Valerio (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria) ; Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ; D'Andreano, Sara (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ; Ceciliani, Fabrizio (Università degli Studi di Milano. Dipartimento di Medicina Veterinaria)
The aim of this study was to define the microbiota of water buffalo milk during sub-clinical and clinical mastitis, as compared to healthy status, by using high-throughput sequencing of the 16S rRNA gene. [...]
2017 - 10.1371/journal.pone.0184710
PloS one, Vol. 12 (september 2017)  
Registro completo - Creative Commons
3.
6 p, 282.5 KB Rapid and real-time identification of fungi up to species level with long amplicon nanopore sequencing from clinical samples / D'Andreano, Sara (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ; Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics) ; Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
The availability of long-read technologies, like Oxford Nanopore Technologies, provides the opportunity to sequence longer fragments of the fungal ribosomal operon, up to 6 Kb (18S-ITS1-5. 8S-ITS2-28S) and to improve the taxonomy assignment of the communities up to species level and in real-time. [...]
2020 - 10.1093/biomethods/bpaa026
Biology Methods & Protocols, Vol. 6 (december 2020)  
Registro completo - Creative Commons

Documentos de investigación Encontrados 1 registros  
1.
127 p, 2.7 MB The forgotten world of mycobiome in the skin of dogs / D'Andreano, Sara ; Francino, Olga, dir. ; Sánchez Bonastre, Armando, dir.
La paraula microbioma inclou el conjunt de microbis que habiten un microhàbitat comú. Els mètodes de seqüenciació de nova generació van permetre la caracterització de les comunitats microbianes que viuen en les diferents parts del cos, tant humà com animals, la seva diversitat, les interaccions amb l'hoste (cèl·lula o immunitat), l'ambient i també entre microbis. [...]
La palabra microbioma incluye el conjunto de microbios que habitan un microhábitat común. Los métodos de secuenciación de nueva generación permitieron la caracterización de las comunidades microbianas que viven en las diferentes partes del cuerpo, tanto humano como animales, su diversidad, las interacciones con el huésped (célula o inmunidad), el ambiente y también entre microbios. [...]
The word microbiome includes the set of microbes that inhabit a common microhabitat. It refers not only to the bacterial community but to fungi and viruses too. Next-generation sequencing methods allowed the characterization of the microbial communities living in different part of the body either human or animal, their diversity, the interactions with the host (cell or immunity), the environment and the microbes. [...]
2020  
Registro completo - Creative Commons

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