Els òrgans de govern dela Facultat de Filosofia i Lletres són la Junta de Facultat, la Junta Permanent i el degà amb el seu equip.

La Facultat també esta formada pels òrgans següents: els coordinadors —i els sotscoordinadors— d’estudis de les titulacions que s’hi imparteixen, els coordinadors generals de programes d’intercanvi, la Junta Electoral de Facultat i l’Assemblea d’Estudiants de la Facultat de Filosofia i Lletres.

La Junta de Facultat és l’òrgan col·legiat de govern de la Facultat de Filosofia i Lletres i es compon de representants del personal acadèmic, del personal investigador en formació que exerceixi algun tipus d’activitat docent a la Facultat, dels estudiants de tots els ensenyaments i titulacions que s’hi imparteixen, i del personal d’administració i serveis de la Facultat.

La Junta Permanent, delegada de la Junta de Facultat, és l'òrgan de govern ordinari de la Facultat. Està formada pel degà i els membres del seu equip, els coordinadors de les titulacions de la Facultat,un representant del professorat amb dedicació docent a la Facultat de cada un dels departaments que hi estan adscrits que ha de ser membre de l’equip de direcció del departament corresponent,  dos professors amb dedicació docent a la Facultat, en representació del professorat contractat temporalment; quatre representants del personal d’administració i serveis, l’administrador de centre i la persona responsable de la gestió acadèmica de la Facultat, una persona representant dels becaris postgraduats, amb dedicació docent, dels departaments adscrits a la Facultat, i una representació dels estudiants igual al nombre de professors que formen part de la Junta Permanent i que no en siguin membres nats (degà i equip de deganat) en el moment en què es convoquin les eleccions d’aquest estament.

El secretari de la Facultat també ho és de la Junta Permanent.