Eigenfactor fa servir un algoritme basat en la teoria de xarxes semblant al PageRank de Google.
Eigenfactor Score= Nombre d’articles d’una revista publicats en els últims 5 anys que han estat citats en l’any de càlcul del JCR.
Article Inluence Score= És l’EigenFactor Score dividit entre la fracció d’articles publicats per la revista. Aquesta fracció està normalitzada, de forma que la suma total d’articles de totes les revistes és 1. El valor mitjà és 1.00, si l’Article Influence Score és superior a 1.00, vol dir que la revista té una influència superior a la mitjana.