Web of Science: 228 citas, Scopus: 248 citas, Google Scholar: citas,
DnaSP 6 : DNA sequence polymorphism analysis of large data sets
Rozas, Julio (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Ferrer-Mata, Albert (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Sánchez-DelBarrio, Juan Carlos (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Guirao-Rico, Sara (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Librado, Pablo (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Ramos-Onsins, Sebastián E. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Sánchez-Gracia, Alejandro (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)

Fecha: 2017
Resumen: We present version 6 of the DnaSP (DNA Sequence Polymorphism) software, a new version of the popular tool for performing exhaustive population genetic analyses on multiple sequence alignments. This major upgrade incorporates novel functionalities to analyse large datasets, such as those generated by high-throughput sequencing (HTS) technologies. Among other features, DnaSP 6 implements: i) modules for reading and analysing data from genomic partitioning methods, such as RADseq or hybrid enrichment approaches, ii) faster methods scalable for HTS data, and iii) summary statistics for the analysis of multi-locus population genetics data. Furthermore, DnaSP 6 includes novel modules to perform single- and multi-locus coalescent simulations under a wide range of demographic scenarios. The DnaSP 6 program, with extensive documentation, is freely available at http://www. ub. edu/dnasp.
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/AGL2016-78709-R
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/CGL2016-75255
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/CGL2013-45211
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/AGL2013-41834-R
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/BFU2010-15484
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2009/SGR-1287
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2014/SGR-1055
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2014/BP-B 00027
Derechos: Tots els drets reservats
Lengua: Anglès.
Documento: article ; recerca ; acceptedVersion
Materia: Coalescent Simulations ; Population Genetics Software ; RADseq Analysis ; SNPs ; VCF
Publicado en: Molecular biology and evolution, Vol. 34, issue 12 (Dec. 2017) p. 3299-3302, ISSN 0737-4038

DOI: 10.1093/molbev/msx248


Post-print
17 p, 500.1 KB

El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación > Documentos de los grupos de investigación de la UAB > Centros y grupos de investigación (producción científica) > Ciencias > CRAG (Centro de Investigación en Agrigenómica)
Artículos > Artículos de investigación
Artículos > Artículos publicados

 Registro creado el 2018-02-07, última modificación el 2019-02-18



   Favorit i Compartir