Web of Science: 22 citas, Scopus: 21 citas, Google Scholar: citas,
Identification of reference genes for RT-qPCR data normalisation in aging studies
González-Bermúdez, Lourdes (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Anglada Pons, Teresa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Genescà, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Martín Flix, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Terradas, Mariona (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)

Fecha: 2019
Resumen: Aging is associated with changes in gene expression levels that affect cellular functions and predispose to age-related diseases. The use of candidate genes whose expression remains stable during aging is required to correctly address the age-associated variations in expression levels. Reverse transcription quantitative-polymerase chain reaction (RT-qPCR) has become a powerful approach for sensitive gene expression analysis. Reliable RT-qPCR assays rely on the normalisation of the results to stable reference genes. Taken these data together, here we evaluated the expression stability of eight frequently used reference genes in three aging models: oncogene-induced senescence (OIS), in vitro and in vivo aging. Using NormFinder and geNorm algorithms, we identified that the most stable reference gene pairs were PUM1 and TBP in OIS, GUSB and PUM1 for in vitro aging and GUSB and OAZ1 for in vivo aging. To validate these candidates, we used them to normalise the expression data of CDKN1A, APOD and TFRC genes, whose expression is known to be affected during OIS, in vitro and in vivo aging. This study demonstrates that accurate normalisation of RT-qPCR data is crucial in aging research and provides a specific subset of stable reference genes for future aging studies.
Ayudas: Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017/SGR-503
Derechos: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Lengua: Anglès
Documento: Article ; recerca ; Versió publicada
Publicado en: Scientific reports, Vol. 9 (September 2019) , art. 13970, ISSN 2045-2322

DOI: 10.1038/s41598-019-50035-0
PMID: 31562345


11 p, 1.4 MB

El registro aparece en las colecciones:
Artículos > Artículos de investigación
Artículos > Artículos publicados

 Registro creado el 2020-06-03, última modificación el 2023-06-04



   Favorit i Compartir