EV-associated miRNAs from pleural lavage as potential diagnostic biomarkers in lung cancer
Roman-Canal, Berta (Hospital Universitari de Bellvitge)
Moiola, Cristian Pablo (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Gatius, Sònia (Institut de Recerca Biomèdica de Lleida)
Bonnin, Sarah (Centre de Regulació Genòmica)
Ruiz-Miró, María (Institut de Recerca Biomèdica de Lleida)
González, Esperanza (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas)
Ojanguren, Amaia (Institut de Recerca Biomèdica de Lleida)
Recuero, José Luis (Institut de Recerca Biomèdica de Lleida)
Gil-Moreno, Antonio 1965- (Hospital Universitari Vall d'Hebron)
Falcón-Pérez, Juan M.. (IKERBASQUE. Basque Foundation for Science)
Ponomarenko, Julia (Centre de Regulació Genòmica)
Porcel, José M. (Institut de Recerca Biomèdica de Lleida)
Matias-Guiu, Xavier (Hospital Universitari de Bellvitge)
Colás Ortega, Eva (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Universitat Autònoma de Barcelona

Fecha:	2019
Resumen:	Lung cancer is the leading cause of cancer-related deaths among men and women in the world, accounting for the 25% of cancer mortality. Early diagnosis is an unmet clinical issue. In this work, we focused to develop a novel approach to identify highly sensitive and specific biomarkers by investigating the use of extracellular vesicles (EVs) isolated from the pleural lavage, a proximal fluid in lung cancer patients, as a source of potential biomarkers. We isolated EVs by ultracentrifuge method from 25 control pleural fluids and 21 pleural lavages from lung cancer patients. Analysis of the expression of EV-associated miRNAs was performed using Taqman OpenArray technology through which we could detect 288 out of the 754 miRNAs that were contained in the OpenArray. The differential expression analysis yielded a list of 14 miRNAs that were significantly dysregulated (adj. p-value < 0. 05 and logFC lower or higher than 3). Using Machine Learning approach we discovered the lung cancer diagnostic biomarkers; miRNA-1-3p, miRNA-144-5p and miRNA-150-5p were found to be the best by accuracy. Accordance with our finding, these miRNAs have been related to cancer processes in previous studies. This results opens the avenue to the use of EV-associated miRNA of pleural fluids and lavages as an untapped source of biomarkers, and specifically, identifies miRNA-1-3p, miRNA-144-5p and miRNA 150-5p as promising biomarkers of lung cancer diagnosis.
Ayudas:	Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017SGR1661 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017SGR1368 Instituto de Salud Carlos III PIE15-00029
Derechos:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicado en:	Scientific reports, Vol. 9 Núm. 1 (january 2019) , p. 15057, ISSN 2045-2322

DOI: 10.1038/s41598-019-51578-y
PMID: 31636323

9 p, 1.7 MB

El registro aparece en las colecciones:
Artículos > Artículos de investigación
Artículos > Artículos publicados