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1.
12 p, 2.4 MB Evaluation of Fourier Transform Infrared Spectroscopy as a First-Line Typing Tool for the Identification of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Klebsiella pneumoniae Outbreaks in the Hospital Setting / Wang-Wang, Jun Hao (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Bordoy, Antoni E. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Martró, Elisa (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Quesada, María Dolores (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Pérez-Vázquez, María (Instituto de Salud Carlos III) ; Guerrero Murillo, Mercedes (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Tiburcio, Andrea (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Navarro, Marina (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Castellà, Laia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Sopena, Nieves (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Casas, Irma (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Saludes, Verónica (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Giménez, Montserrat (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Cardona, Pere-Joan (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Universitat Autònoma de Barcelona
Early detection of pathogen cross-transmission events and environmental reservoirs is needed to control derived nosocomial outbreaks. Whole-genome sequencing (WGS) is considered the gold standard for outbreak confirmation, but, in most cases, it is time-consuming and has elevated costs. [...]
2022 - 10.3389/fmicb.2022.897161
Frontiers in microbiology, Vol. 13 (june 2022)  
Registro completo - Creative Commons
2.
7 p, 2.3 MB Monitoring SARS-CoV-2 variant transitions using differences in diagnostic cycle threshold values of target genes / Bordoy, Antoni E. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Saludes, Verónica (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Panisello Yagüe, David (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ; Clarà, Gemma (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Soler, Laia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Paris de León, Alexia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Casañ, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Blanco-Suárez, Ana (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Guerrero Murillo, Mercedes (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Rodríguez-Ponga, Beatriz (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Noguera-Julian, Marc (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Català-Moll, Francesc (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ; Pey, Irina (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ; Armengol, Maria Pilar (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ; Casadellà, Maria (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ; Parera, Mariona (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ; Pluvinet, Raquel (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ; Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ; Clotet Sala, Bonaventura (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ; Giménez, Montserrat (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Martró, Elisa (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Cardona, Pere-Joan (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Blanco Guillermo, Ignacio (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ; Universitat Autònoma de Barcelona
Monitoring the emergence of new SARS-CoV-2 variants is important to detect potential risks of increased transmission or disease severity. We investigated the identification of SARS-CoV-2 variants from real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) routine diagnostics data. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-25719-9
Scientific reports, Vol. 12 (december 2022)  
Registro completo - Creative Commons
3.
2 p, 74.0 KB Corrigendum : Transmissibility, hospitalization, and intensive care admissions due to omicron compared to delta variants of SARS-CoV-2 in Catalonia: A cohort study and ecological analysis / Català, Martí (University of Oxford) ; Coma, Ermengol (Institut Català de la Salut) ; Alonso Muñoz, Sergio (Universitat Politècnica de Catalunya) ; Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Blanco Guillermo, Ignacio (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Antón, Andrés (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Bordoy, Antoni E. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Cardona, Pere-Joan (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Fina, Francesc (Institut Català de la Salut) ; Martró, Elisa (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Medina, Manuel (Institut Català de la Salut) ; Mora, Núria (Institut Català de la Salut) ; Saludes, Verónica (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Prats, Clara (Universitat Politècnica de Catalunya) ; Prieto-Alhambra, Daniel (University of Oxford) ; Alvarez-Lacalle, Enrique (Universitat Politècnica de Catalunya) ; Universitat Autònoma de Barcelona
We aim to compare the severity of infections between omicron and delta variants in 609,352 SARS-CoV-2 positive cases using local hospitalization, vaccination, and variants data from the Catalan Health Care System (which covers around 7. [...]
2022 - 10.3389/fpubh.2022.1060328
Frontiers in Public Health, Vol. 10 (november 2022)  
Registro completo - Creative Commons
4.
0 p, 2.5 MB Transmissibility, hospitalization, and intensive care admissions due to omicron compared to delta variants of SARS-CoV-2 in Catalonia : A cohort study and ecological analysis / Català, Martí (University of Oxford. Nuffield Department of Orthopedics, Rheumatology and Musculoskeletal Sciences) ; Coma, Ermengol (Institut Català de la Salut) ; Alonso Muñoz, Sergio (Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Física) ; Andrés, Cristina (Instituto de Salud Carlos III) ; Blanco Guillermo, Ignacio (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Antón, Andrés (Instituto de Salud Carlos III) ; Bordoy, Antoni E. (Instituto de Salud Carlos III) ; Cardona, Pere-Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Fina, Francesc (Institut Català de la Salut) ; Martró, Elisa (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Medina, Manuel (Institut Català de la Salut) ; Mora, Núria (Institut Català de la Salut) ; Saludes, Verónica (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Prats, Clara (Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Física) ; Prieto-Alhambra, Daniel (University of Oxford. Nuffield Department of Orthopedics, Rheumatology and Musculoskeletal Sciences) ; Alvarez-Lacalle, Enrique (Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Física)
We aim to compare the severity of infections between omicron and delta variants in 609,352 SARS-CoV-2 positive cases using local hospitalization, vaccination, and variants data from the Catalan Health Care System (which covers around 7. [...]
2022 - 10.3389/fpubh.2022.961030
Frontiers in Public Health, Vol. 10 (August 2022)  
Registro completo - Creative Commons
5.
7 p, 868.2 KB Analytical Performance of Quantitative DiaSorin Liaison SARS-COV-2 Antigen Test for the Asymptomatic Population / Fernandez Rivas, Gema (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Barallat, Jaume (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Gonzalez, Victoria (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Martinez, Silvia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Bordoy, Antoni E. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Jimenez, Laura (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Casañ, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ; Blanco Guillermo, Ignacio (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Background: Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) antigen (Ag) tests have been widely employed to identify patients for a rapid diagnosis and pandemic control. Rapid lateral-flow techniques are currently the most used, but automated technologies have emerged as another viable alternative to molecular methods. [...]
2022 - 10.3389/fpubh.2021.788581
Frontiers in Public Health, Vol. 9 (January 2022)  
Registro completo - Creative Commons

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