Resultados globales: 14 registros encontrados en 0.05 segundos.
Artículos, Encontrados 14 registros
Artículos Encontrados 14 registros  1 - 10siguiente  ir al registro:
1.
17 p, 2.4 MB Quasispecies Fitness Partition to Characterize the Molecular Status of a Viral Population. Negative Effect of Early Ribavirin Discontinuation in a Chronically Infected HEV Patient / Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ibañez-Lligoña, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Adombie, Caroline Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pintó, Rosa (Universitat de Barcelona) ; Guix, Susana (Universitat de Barcelona) ; Bosch, Albert (Universitat de Barcelona) ; Domingo, Esteban (Instituto de Salud Carlos III) ; Gallego, Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Perales Viejo, Celia (Universidad Autónoma de Madrid) ; Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Universitat Autònoma de Barcelona
The changes occurring in viral quasispecies populations during infection have been monitored using diversity indices, nucleotide diversity, and several other indices to summarize the quasispecies structure in a single value. [...]
2022 - 10.3390/ijms232314654
International journal of molecular sciences, Vol. 23 (november 2022)  
2.
15 p, 348.7 KB Bioinformatic Tools for NGS-Based Metagenomics to Improve the Clinical Diagnosis of Emerging, Re-Emerging and New Viruses / Ibañez-Lligoña, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Colomer-Castell, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Campos, Carolina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Garcia-Cehic, D (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Internacional de Catalunya) ; Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Epidemics and pandemics have occurred since the beginning of time, resulting in millions of deaths. Many such disease outbreaks are caused by viruses. Some viruses, particularly RNA viruses, are characterized by their high genetic variability, and this can affect certain phenotypic features: tropism, antigenicity, and susceptibility to antiviral drugs, vaccines, and the host immune response. [...]
2023 - 10.3390/v15020587
Viruses, Vol. 15, Issue 2 (February 2023) , art. 587  
3.
11 p, 1.5 MB The frequency of defective genomes in Omicron differs from that of the Alpha, Beta and Delta variants / Campos, Carolina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Borras Bermejo, Blanca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Parés-Badell, Oleguer (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Adombi, Caroline Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ibañez-Lligoña, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esperalba, Juliana (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Codina, María Gema (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Saubí, Narcis (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
The SARS-CoV-2 Omicron variant emerged showing higher transmissibility and possibly higher resistance to current COVID-19 vaccines than other variants dominating the global pandemic. In March 2020 we performed a study in clinical samples, where we found that a portion of genomes in the SARS-CoV-2 viral population accumulated deletions immediately before the S1/S2 cleavage site (furin-like cleavage site, PRRAR/S) of the spike gene, generating a frameshift and appearance of a premature stop codon. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-24918-8
Scientific reports, Vol. 12 (december 2022)  
4.
23 p, 2.1 MB Next-Generation Sequencing for Confronting Virus Pandemics / Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ibáñez, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron)
Virus pandemics have happened, are happening and will happen again. In recent decades, the rate of zoonotic viral spillover into humans has accelerated, mirroring the expansion of our global footprint and travel network, including the expansion of viral vectors and the destruction of natural spaces, bringing humans closer to wild animals. [...]
2022 - 10.3390/v14030600
Viruses, Vol. 14 (march 2022)  
5.
15 p, 703.1 KB Ultra-Deep Pyrosequencing Detects Conserved Genomic Sites and Quantifies Linkage of Drug-Resistant Amino Acid Changes in the Hepatitis B Virus Genome / Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ortega, Israel (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Domingo, Esteban (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Cubero, María Dolores (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Camós Anguila, Sílvia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ferrer, Carles (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Sánchez, Alex (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Jardí, Rosendo (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Schaper, Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Homs, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Guardia Massó, Jaume (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban, Rafael (Esteban Mur) (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Universitat Autònoma de Barcelona
Selection of amino acid substitutions associated with resistance to nucleos(t)ide-analog (NA) therapy in the hepatitis B virus (HBV) reverse transcriptase (RT) and their combination in a single viral genome complicates treatment of chronic HBV infection and may affect the overlapping surface coding region. [...]
2012 - 10.1371/journal.pone.0037874
PloS one, Vol. 7 (may 2012)  
6.
13 p, 470.0 KB Ultra-Deep Pyrosequencing (UDPS) Data Treatment to Study Amplicon HCV Minor Variants / Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Cubero, María Dolores (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Perales Viejo, Celia (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Casillas, Rosario (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Alvarez-Tejado, Miguel (Roche Diagnostics, Sant Cugat del Vallès) ; Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Guardia Massó, Jaume (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona)
We have investigated the reliability and reproducibility of HCV viral quasispecies quantification by ultra-deep pyrosequencing (UDPS) methods. Our study has been divided in two parts. First of all, by UDPS sequencing of clone mixes samples we have established the global noise level of UDPS and fine tuned a data treatment workflow previously optimized for HBV sequence analysis. [...]
2013 - 10.1371/journal.pone.0083361
PloS one, Vol. 8 (december 2013)  
7.
15 p, 3.3 MB Pipeline for specific subtype amplification and drug resistance detection in hepatitis C virus / Soria, María Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Chen, Qian (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Llorens, Meritxell (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; de Ávila, Ana Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Beach, Nathan M. (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Buti, Maria (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Esteban, Rafael (Esteban Mur) (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Perales Viejo, Celia (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa)
Despite the high sustained virological response rates achieved with current directly-acting antiviral agents (DAAs) against hepatitis C virus (HCV), around 5-10% of treated patients do not respond to current antiviral therapies, and basal resistance to DAAs is increasingly detected among treatment-naïve infected individuals. [...]
2018 - 10.1186/s12879-018-3356-6
BMC Infectious diseases, Vol. 18 (september 2018)  
8.
14 p, 8.0 MB Characterization of intra- and inter-host norovirus P2 genetic variability in linked individuals by amplicon sequencing / Sabrià, Aurora (Universitat de Barcelona. Institut de Recerca en Nutrició i Seguretat Alimentària) ; Pintó, Rosa (Universitat de Barcelona. Institut de Recerca en Nutrició i Seguretat Alimentària) ; Bosch, Albert (Universitat de Barcelona. Institut de Recerca en Nutrició i Seguretat Alimentària) ; Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Domínguez, Ángela (Universitat de Barcelona. Departament de Salut Pública) ; Carol, Mónica (Agència de Salut Pública de Catalunya) ; Sala-Farré, Maria-Rosa (Agència de Salut Pública de Catalunya) ; Guix, Susana (Universitat de Barcelona. Institut de Recerca en Nutrició i Seguretat Alimentària) ; Universitat Autònoma de Barcelona
Noroviruses are the main cause of epidemics of acute gastroenteritis at a global scale. Although chronically infected immunocompromised individuals are regarded as potential reservoirs for the emergence of new viral variants, viral quasispecies distribution and evolution patterns in acute symptomatic and asymptomatic infections has not been extensively studied. [...]
2018 - 10.1371/journal.pone.0201850
PloS one, Vol. 13 (august 2018)  
9.
13 p, 3.0 MB Naturally occurring SARS-CoV-2 gene deletions close to the spike S1/S2 cleavage site in the viral quasispecies of COVID19 patients / Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Roche Diagnostics SL (Sant Cugat del Valles)) ; Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Guerrero Murillo, Mercedes (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esperalba, Juliana (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Goterris, Lidia (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Codina, María Gema (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Quer, Susanna (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Martín, Maria Carmen (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Campins Martí, Magda (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Ferrer, Ricard (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Almirante Gragera, Benito (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
The SARS-CoV-2 spike (S) protein, the viral mediator for binding and entry into the host cell, has sparked great interest as a target for vaccine development and treatments with neutralizing antibodies. [...]
2020 - 10.1080/22221751.2020.1806735
Emerging microbes & infections, Vol. 9 Núm. 1 (september 2020) , p. 1900-1911  
10.
6 p, 619.9 KB Hepatitis C virus intrinsic molecular determinants may contribute to the development of cholestatic hepatitis after liver transplantation / Gambato, Martina (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Koutsoudakis, George (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; González, Patricia (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Caro-Pérez, Noelia (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; García-González, Neris (Joint Research Unit Infección y Salud Pública. FISABIO-Universitat de Valéncia) ; González-Candelas, Fernando (Joint Research Unit Infección y Salud Pública. FISABIO-Universitat de Valéncia) ; Ignacio Esteban, Juan (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Crespo, Gonzalo (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Navasa, Miquel (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Forns, Xavier (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Pérez-Del-Pulgar, Sofía (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Cholestatic hepatitis C (CHC) is a severe form of hepatitis C virus (HCV) infection recurrence that leads to high graft loss rates early after liver transplantation (LT). To investigate the pathogenic mechanisms of CHC, we analysed HCV quasispecies in CHC patients compared to a control group (mild hepatitis C recurrence) by deep pyrosequencing. [...]
2019 - 10.1099/jgv.0.001175
The Journal of general virology, Vol. 100 Núm. 1 (january 2019) , p. 63-68  

Artículos : Encontrados 14 registros   1 - 10siguiente  ir al registro:
¿Le interesa recibir alertas sobre nuevos resultados de esta búsqueda?
Defina una alerta personal vía correo electrónico o subscríbase al canal RSS.