dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciències de la Computació)
| Título variante: |
Web server for genome comparison and making of the phylogenetic tree |
| Título variante: |
Servidor web per la comparació de genomes y creació de l'arbre filogenètic |
| Fecha: |
2017-02-07 |
| Resumen: |
Los seres vivos compartimos parte de nuestro código genético entre distintas especies. Estudiar la similitud del código genético del ser humano con otras especies animales permite extrapolar conclusiones de experimentos con animales, e incluso conocer el carácter evolutivo de una enfermedad. Este proyecto ayuda a realizar este tipo de investigación ofreciendo una aplicación web que permite comparar el código genético de los genomas de todos los seres vivos. En la aplicación web se pueden comparar genomas de eucariota, bacterias y arquea. La aplicación web muestra un árbol filogenético para cada tipo de organismos. Este árbol representa visualmente la similitud entre distintas especies de eucariotas, bacterias y arqueas, así como su ascendencia común. Posteriormente, una vez seleccionados en el árbol los genomas que se quieren comparar, el visor en detalle permite ver qué partes de un genoma se conservan en el resto de genomas. |
| Resumen: |
We, living creatures, share out genetic code between species. Studying the similitude between the genetic code of the human being and other animal species makes it easier to extract conclusions from animal testing, and grants information about the origin of some diseases. This project helps this type of investigation offering a web application that allow for the comparison of the genomes of all living creatures. In this web application, genomes of eukaryote, bacteria and archaea can be compared. The web application shows a phylogenetic tree for each type of organism. This phylogenetic tree visually represents the similitude between species of eukaryote, bacteria and archaea, and also shows their shared ancestors. The genomes in the tree can be selected to open the detailed view of the comparison between the selected genomes. The detailed view allows for the viewing of parts of the genomes that are conserved in other genomes. |
| Resumen: |
Els éssers vius compartim part del nostre codi genètic entre diferents espècies. Estudiar la similitud del codi genètic de l'ésser humà amb altres espècies permet extrapolar conclusions d'experiments amb animals, i també conèixer el caràcter evolutiu d'una malaltia. Aquest projecte ajuda a realitzar aquest tipus d'investigació oferint una aplicació web que permet comparar el codi genètic dels genomes de tots els éssers vius. A l'aplicació web es poden comparar genomes d'eucariota, bacteri i arqueu. L'aplicació web mostra un arbre filogenètic per a cada tipus d'organisme. Aquest arbre representa visualment la similitud entre distintes espècies d'eucariotes, bacteris i arqueus, i també la seva ascendència comú. Posteriorment, un cop seleccionats a l'arbre els genomes que es vulguin comparar el visor en detall permet veure quines parts d'un genoma es conserven a la resta de genomes. |
| Derechos: |
Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.  |
| Lengua: |
Castellà |
| Titulación: |
Grau en Enginyeria Informàtica [2502441] |
| Plan de estudios: |
Enginyeria Informàtica [958] |
| Documento: |
Treball final de grau ; Text |
| Área temática: |
Menció Computació |
| Materia: |
Arbre filogenétic ;
Arqueus ;
Bacteris ;
Bioinformàtica ;
Eucariotes ;
Gen ;
Genoma ;
MUM ;
NCBI ;
SMUM ;
Árbol filogenético ;
Arquea ;
Bacteria ;
Bioinformática ;
Eucariota ;
Archaea ;
Bioinformatics ;
Eukaryota ;
Gene ;
Phylogenetic tree |
visitante ::
identificación
dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciències de la Computació)
