Phylogenomics of the olive tree (Olea europaea) reveals the relative contribution of ancient allo- and autopolyploidization events
Julca, Irene (Universitat Autònoma de Barcelona)
Marcet-Houben, Marina (Centre de Regulació Genòmica)
Vargas, Pablo, (Vargas Gómez) (Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Real Jardín Botànico de Madrid)
Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica)

Data:	2018
Resum:	Polyploidization is one of the major evolutionary processes that shape eukaryotic genomes, being particularly common in plants. Polyploids can arise through direct genome doubling within a species (autopolyploidization) or through the merging of genomes from distinct species after hybridization (allopolyploidization). The relative contribution of both mechanisms in plant evolution is debated. Here we used phylogenomics to dissect the tempo and mode of duplications in the genome of the olive tree (Olea europaea), one of the first domesticated Mediterranean fruit trees. Our results depict a complex scenario involving at least three past polyploidization events, of which two-at the bases of the family Oleaceae and the tribe Oleeae, respectively-are likely to be the result of ancient allopolyploidization. A more recent polyploidization involves specifically the olive tree and relatives. Our results show the power of phylogenomics to distinguish between allo- and auto polyploidization events and clarify the contributions of duplications in the evolutionary history of the olive tree. The online version of this article (10. 1186/s12915-018-0482-y) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Ajuts:	Ministerio de Economía y Competitividad SEV-2012-0208 Ministerio de Economía y Competitividad BFU2015-67107 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca SGR857 European Commission 642095 European Commission 724173
Nota:	Altres ajuts: TG and PV acknowledge support from Banco Santander for the olive genome sequencing project. IJ was supported in part by a grant from the Peruvian Ministry of Education, "Beca Presidente de la República" (2013-III).
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Olive ; Lamiales ; Polyploidy ; Phylogenomics ; Hybridization
Publicat a:	BMC biology, Vol. 16 (january 2018) , ISSN 1741-7007

DOI: 10.1186/s12915-018-0482-y
PMID: 29370802

15 p, 1.7 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats