Agreement and differential use of laboratory methods for the detection and quantification of SARS-CoV-2 in experimentally infected animals
Usai, Carla (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Pailler-García, Lola (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Lorca-Oró, Cristina (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Fernández-Bastit, Leira (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Roca, Núria (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Brustolin, Marco (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Rodon, Jordi (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Pérez, Mónica (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Cantero, Guillermo (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Carrillo, Jorge (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas)
Izquierdo Useros, Nuria (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas)
Blanco, Julià (Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya)
Clotet Sala, Bonaventura (Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya)
Napp Avelli, Sebastián (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Segalés Coma, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
Vergara-Alert, Júlia (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)

Data:	2022
Resum:	Rodents are widely used for the development of COVID-19-like animal models, the virological outcome being determined through several laboratory methods reported in the literature. Our objective was to assess the agreement between methods performed on different sample types from 342 rodents experimentally infected with SARS-CoV-2 (289 golden Syrian hamsters and 53 K18-hACE2 mice). Our results showed moderate agreement between methods detecting active viral replication, and that increasing viral loads determined by either RT-qPCR or infectious viral titration corresponded to increasing immunohistochemical scores. The percentage of agreement between methods decreased over experimental time points, and we observed poor agreement between RT-qPCR results and viral titration from oropharyngeal swabs. In conclusion, RT-qPCR and viral titration on tissue homogenates are the most reliable techniques to determine the presence and replication of SARS-CoV-2 in the early and peak phases of infection, and immunohistochemistry is valuable to evaluate viral distribution patterns in the infected tissues.
Ajuts:	Ministerio de Ciencia e Innovación PID2020-117145RB-I00 European Commission. Horizon 2020 101046118
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 ; RT-qPCR ; Virus titration ; Immunohistochemistry ; Comparison ; Agreement ; Tissues ; Oropharyngeal swab
Publicat a:	Frontiers in microbiology, Vol. 13 (november 2022) , ISSN 1664-302X

DOI: 10.3389/fmicb.2022.1016201
PMID: 36458182

10 p, 3.0 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA-IRTA)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats