visitante ::
identificación
|
|||||||||||||||
Buscar | Enviar | Ayuda | Servicio de Bibliotecas | Sobre el DDD | Català English Español |
Página principal > Artículos > Artículos publicados > A generalized Watterson estimator for next-generation sequencing : |
Fecha: | 2015 |
Resumen: | Several variations of the Watterson estimator of variability for Next Generation Sequencing (NGS) data have been proposed in the literature. We present a unified framework for generalized Watterson estimators based on Maximum Composite Likelihood, which encompasses most of the existing estimators. We propose this class of unbiased estimators as generalized Watterson estimators for a large class of NGS data, including pools and trios. We also discuss the relation with the estimators proposed in the literature and show that they admit two equivalent but seemingly different forms, deriving a set of combinatorial identities as a byproduct. Finally, we give a detailed treatment of Watterson estimators for single or multiple autopolyploid individuals. |
Ayudas: | Ministerio de Educación y Ciencia AGL2013-41834-R Ministerio de Ciencia e Innovación CGL2009-09346 Ministerio de Ciencia e Innovación CSD2007-00036 |
Derechos: | Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades. |
Lengua: | Anglès |
Documento: | Article ; recerca ; Versió acceptada per publicar |
Materia: | Site frequency spectrum ; Population genetics ; Summary statistics ; Maximum likelihood ; Composite likelihood |
Publicado en: | Theoretical population biology, Vol. 100 (March 2015) , p. 79-87, ISSN 0040-5809 |
Post-print 25 p, 1.2 MB |