Development of a new methodology to predict and engineer thermostable proteins
Robles Martín, Ana
Guallar, Victor, dir. (Barcelona Supercomputing Center)
Masgrau, Laura, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Universitat Autònoma de Barcelona.
Facultat de Biociències
Fecha: |
2020 |
Descripción: |
71 pag. |
Resumen: |
Studies of protein thermostability change prediction due to single mutations has been of great interest because of its importance for industries, biotechnological and biomedical research. However, the search of a highly accurate predictor has been unsuccessful. In this thesis, we have developed four metapredictors, from which RF-Classifier, and its combined model with RF-Regressor, has the best performance. Its main goal is to take advantage of all the other predictors' strengths and minimize their weaknesses Besides, we have conducted three retrospective studies and a prospective one with an alpha/beta hydrolase to filter and select the most stabilizing mutations. |
Resumen: |
Els estudis sobre la predicció del canvi de termoestabilitat de proteïnes a causa de mutacions individuals han estat de gran interès per la seva importància per a la indústria, la investigació biotecnològica i biomèdica. Tot i això, la cerca d'un predictor d'alta precisió no ha tingut èxit. En aquesta tesi, hem desenvolupat quatre metapredictors, dels quals el classificador de RF i el seu model combinat amb RF-Regressor tenen el millor rendiment. El seu principal objectiu és aprofitar tots els punts forts dels altres predictors i minimitzar-ne els punts febles. A més, hem dut a terme tres estudis retrospectius i un altre potencial amb una alfa / beta hidrolasa per filtrar i seleccionar les mutacions més estabilitzadores. |
Derechos: |
Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan aquestes es distribueixin sota la mateixa llicència que regula l'obra original i es reconegui l'autoria de l'obra original. |
Lengua: |
Anglès |
Plan de estudios: |
Màster Universitari en Bioinformàtica / Bioinformatics [1112] |
Documento: |
Treball de fi de postgrau |
Materia: |
Protein stability ;
Computational tools and databases ;
Machine learning ;
Metapredictor ;
Thermostability predictor ;
Integrated prediction ;
Estabilitat de les proteïnes ;
Eines computacionals i bases de dades ;
Aprenentatge automàtic, Metapredictor ;
Predictor de termostabilitat ;
Predicció integrada |
El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación >
Trabajos de investigación y proyectos de final de carrera >
Biociencias. TFM
Registro creado el 2021-03-18, última modificación el 2022-10-22