Development of a new methodology to predict and engineer thermostable proteins
Robles Martín, Ana
Guallar, Victor, dir. (Barcelona Supercomputing Center)
Masgrau, Laura, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències

Fecha:	2020
Descripción:	71 pag.
Resumen:	Studies of protein thermostability change prediction due to single mutations has been of great interest because of its importance for industries, biotechnological and biomedical research. However, the search of a highly accurate predictor has been unsuccessful. In this thesis, we have developed four metapredictors, from which RF-Classifier, and its combined model with RF-Regressor, has the best performance. Its main goal is to take advantage of all the other predictors' strengths and minimize their weaknesses Besides, we have conducted three retrospective studies and a prospective one with an alpha/beta hydrolase to filter and select the most stabilizing mutations.
Resumen:	Els estudis sobre la predicció del canvi de termoestabilitat de proteïnes a causa de mutacions individuals han estat de gran interès per la seva importància per a la indústria, la investigació biotecnològica i biomèdica. Tot i això, la cerca d'un predictor d'alta precisió no ha tingut èxit. En aquesta tesi, hem desenvolupat quatre metapredictors, dels quals el classificador de RF i el seu model combinat amb RF-Regressor tenen el millor rendiment. El seu principal objectiu és aprofitar tots els punts forts dels altres predictors i minimitzar-ne els punts febles. A més, hem dut a terme tres estudis retrospectius i un altre potencial amb una alfa / beta hidrolasa per filtrar i seleccionar les mutacions més estabilitzadores.
Derechos:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan aquestes es distribueixin sota la mateixa llicència que regula l'obra original i es reconegui l'autoria de l'obra original.
Lengua:	Anglès
Plan de estudios:	Màster Universitari en Bioinformàtica / Bioinformatics [1112]
Documento:	Treball de fi de postgrau
Materia:	Protein stability ; Computational tools and databases ; Machine learning ; Metapredictor ; Thermostability predictor ; Integrated prediction ; Estabilitat de les proteïnes ; Eines computacionals i bases de dades ; Aprenentatge automàtic, Metapredictor ; Predictor de termostabilitat ; Predicció integrada

75 p, 3.3 MB

El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación > Trabajos de investigación y proyectos de final de carrera > Biociencias. TFM