XTEND : Extending the depth of field in cryo soft X-ray tomography
Oton, Joaquin (Centro Nacional de Biotecnología)
Pereiro, Eva (Laboratori de Llum del Sincrotró ALBA)
Conesa, José J. (Centro Nacional de Biotecnología)
Chichón, Francisco J. (Centro Nacional de Biotecnología)
Luque, Daniel (Centro Nacional de Microbiología (Espanya))
Rodríguez, Javier M. (Centro Nacional de Microbiología (Espanya))
Pérez-Berná, Ana J. (Laboratori de Llum del Sincrotró ALBA)
Sorzano, Carlos Oscar S. (Centro Nacional de Biotecnología)
Klukowska, Joanna (City University of New York. Department of Computer Science, The Graduate Center)
Herman, Gabor T. (City University of New York. Department of Computer Science, The Graduate Center)
Vargas, Javier (Centro Nacional de Biotecnología)
Marabini, Roberto (Universidad Autònoma de Madrid. Escuela Politécnica Superior)
Carrascosa, José L. (Centro Nacional de Biotecnología)
Carazo, José M. (Centro Nacional de Biotecnología)

Date:	2017
Abstract:	We have developed a new data collection method and processing framework in full field cryo soft X-ray tomography to computationally extend the depth of field (DOF) of a Fresnel zone plate lens. Structural features of 3D-reconstructed eukaryotic cells that are affected by DOF artifacts in standard reconstruction are now recovered. This approach, based on focal series projections, is easily applicable with closed expressions to select specific data acquisition parameters.
Grants:	Ministerio de Economía y Competitividad BFU2014-54181 Ministerio de Economía y Competitividad BIO2013-44647-R Agencia Estatal de Investigación BIO2016-76400-R European Commission 283570 European Commission 653706
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Published in:	Scientific reports, Vol. 7 (Abril 2017) , art. 45808, ISSN 2045-2322

DOI: 10.1038/srep45808
PMID: 28374769

12 p, 3.5 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Experimental sciences > The ALBA Synchrotron
Articles > Research articles
Articles > Published articles