Mutational signatures are markers of drug sensitivity of cancer cells
Levatić, Jurica (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona))
Salvadores, Marina (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona))
Fuster-Tormo, Francisco (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Supek, Fran (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Universitat Autònoma de Barcelona

Fecha:	2022
Resumen:	Genomic analyses have revealed mutational footprints associated with DNA maintenance gone awry, or with mutagen exposures. Because cancer therapeutics often target DNA synthesis or repair, we asked if mutational signatures make useful markers of drug sensitivity. We detect mutational signatures in cancer cell line exomes (where matched healthy tissues are not available) by adjusting for the confounding germline mutation spectra across ancestries. We identify robust associations between various mutational signatures and drug activity across cancer cell lines; these are as numerous as associations with established genetic markers such as driver gene alterations. Signatures of prior exposures to DNA damaging agents - including chemotherapy - tend to associate with drug resistance, while signatures of deficiencies in DNA repair tend to predict sensitivity towards particular therapeutics. Replication analyses across independent drug and CRISPR genetic screening data sets reveal hundreds of robust associations, which are provided as a resource for drug repurposing guided by mutational signature markers.
Ayudas:	European Commission. Horizon 2020 965193 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca PID2020-118795GB-I00 European Commission. Horizon 2020 754510 European Commission. Horizon 2020 757700 Ministerio de Ciencia e Innovación CEX2019-000913-S
Derechos:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Materia:	DNA ; DNA Mutational Analysis ; Drug Resistance ; Exome ; Humans ; Mutation ; Neoplasms
Publicado en:	Nature communications, Vol. 13 Núm. 1 (december 2022) , p. 2926, ISSN 2041-1723

DOI: 10.1038/s41467-022-30582-3
PMID: 35614096

19 p, 3.0 MB

El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación > Documentos de los grupos de investigación de la UAB > Centros y grupos de investigación (producción científica) > Ciencias de la salud y biociencias > Institut d'Investigació en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP) > Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras
Artículos > Artículos de investigación
Artículos > Artículos publicados