Viral culture and immunofluorescence for the detection of SARS-CoV-2 infectivity in RT-PCR positive respiratory samples
Berengua, Carla (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
López Ruiz, Marina (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Esteban, Montserrat (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Marín, Pilar (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Ramos, Paula (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
del Cuerpo Casas, Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Gich, Ignasi (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Navarro Risueño, Ferran (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Miró, Elisenda (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Rabella, Núria (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)

Data:	2022
Descripció:	6 pàg.
Resum:	Background: Knowing how long SARS-CoV-2-positive individuals can remain infective is crucial for the design of infection prevention and control strategies. Viral culture is the gold standard for detecting an active-replicative virus and evaluating its infectious potential. Objective: To assess the correlation of SARS-CoV-2 infectivity with the number of days from symptom onset and the Ct value, using culture as a reference method. Also, to describe a detailed protocol for SARS-CoV-2 culture and immunofluorescence confirmation based on our experience with other respiratory viruses. Study design: 100 consecutive respiratory samples positive for SARS-CoV-2 by RT-PCR from different subjects were inoculated into VERO E6 cells. Results: Viral isolation was successful in 58% of samples. The median number of days from symptom onset for culture-positive samples was 2, and 15 for culture-negative samples. Six positive cultures were obtained in patients ≥14 days after symptom onset, all of whom were immunocompromised orwith severe COVID-19. The mean Ct value was 12. 64 units higher in culture-negative than in culture-positive samples. The probability of successfully isolating SARS-CoV-2 in samples with a Ct value <22 was 100%, decreasing to 3. 1% when >27. Conclusions: Our findings show a significant positive correlation between the probability of isolating SARS-CoV-2 in culture, fewer days of symptoms and a lower RT-PCR Ct value. SARS-CoV-2 infectivity lasts no more than 14 days from symptom onset in immunocompetent individuals. In contrast, in immunocompromised patients or those with severe COVID-19 infectivity may remain after 14 days. Ct value <22 always indicates infectivity.
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió acceptada per publicar
Matèria:	COVID-19 ; Infectivity ; SARS-CoV-2 ; VERO E6 cells ; Viral culture ; Viral isolation ; SDG 3 - Good Health and Well-being
Publicat a:	Journal of Clinical Virology, Vol. 152 (July 2022) , art. 105167, ISSN 1873-5967

DOI: 10.1016/j.jcv.2022.105167
PMID: 35523105

Postprint 22 p, 639.2 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats