Serum DNA methylome of the colorectal cancer serrated pathway enables non-invasive detection
Gallardo-Gómez, María (Universidade de Vigo)
Costas-Ríos, Lara (Universidade de Vigo)
García-Prieto, Carlos A (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Álvarez-Rodríguez, Lara (Universidade de Vigo)
Bujanda, Luis (Universidad del País Vasco)
Barrero, Maialen (Hospital de Donostia (Sant Sebastià, País Basc))
Castells, Antoni (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Balaguer, Francesc (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Jover, Rodrigo (Universidad Miguel Hernández, Alicante)
Esteller, M (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Tardío Baiges, Antoni (Instituto de Investigación Biomédica Galicia Sur)
González-Carreró Fojón, Joaquín (Instituto de Investigación Biomédica Galicia Sur)
Cubiella, Joaquín (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd), Ourense)
De Chiara, Loretta (Universidade de Vigo)

Fecha:	2023
Resumen:	The clinical relevance of the colorectal cancer serrated pathway is evident, but the screening of serrated lesions remains challenging. We aimed to characterize the serum methylome of the serrated pathway and to evaluate circulating cell-free DNA (cfDNA) methylomes as a potential source of biomarkers for the non-invasive detection of serrated lesions. We collected serum samples from individuals with serrated adenocarcinoma (SAC), traditional serrated adenomas, sessile serrated lesions, hyperplastic polyps and individuals with no colorectal findings. First, we quantified cfDNA methylation with the MethylationEPIC array. Then, we compared the methylation profiles with tissue and serum datasets. Finally, we evaluated the utility of serum cfDNA methylation biomarkers. We identified a differential methylation profile able to distinguish high-risk serrated lesions from no serrated neoplasia, showing concordance with tissue methylation from SAC and sessile serrated lesions. Serum methylation profiles are pathway-specific, clearly separating serrated lesions from conventional adenomas. The combination of ninjurin 2 (NINJ2) and glutamate-rich 1 (ERICH1) methylation discriminated high-risk serrated lesions and SAC with 91. 4% sensitivity (64. 4% specificity), while zinc finger protein 718 (ZNF718) methylation reported 100% sensitivity for the detection of SAC (96% specificity). This is the first study exploring the serum methylome of serrated lesions. Differential methylation of cfDNA can be used for the non-invasive detection of colorectal serrated lesions.
Ayudas:	Ministerio de Economía y Competitividad PI15/02007 Ministerio de Educación, Cultura y Deporte FPU15/02350 Ministerio de Economía y Competitividad PT13/0010/0044
Derechos:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Materia:	Circulating cell-free DNA ; DNA methylation ; Non-invasive biomarkers ; Screening ; Serrated colorectal cancer ; Serrated lesions
Publicado en:	Molecular Oncology, 2023 , ISSN 1878-0261

DOI: 10.1002/1878-0261.13573

18 p, 1.8 MB

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