PyAMPA : a high-throughput prediction and optimization tool for antimicrobial peptides
Ramos-Llorens, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Bello-Madruga, Roberto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Valle García, Javier (Universitat Pompeu Fabra)
Andreu Martínez, David (Universitat Pompeu Fabra)
Torrent Burgas, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)

Date:	2024
Abstract:	This paper introduces PyAMPA, a new bioinformatics platform designed for the discovery and optimization of antimicrobial peptides (AMPs). It addresses the urgent need for new antimicrobials due to the rise of antibiotic-resistant infections. PyAMPA, with its five predictive modules -AMPScreen, AMPValidate, AMPSolve, AMPMutate and AMPOptimize, enables high-throughput screening of proteomes to identify potential AMP motifs and optimize them for clinical use. Its unique approach, combining prediction, design, and optimization tools, makes PyAMPA a robust solution for developing new AMP-based therapies, offering a significant advance in combatting antibiotic resistance.
Grants:	Agencia Estatal de Investigación PID2020-113184RB-C22 Agencia Estatal de Investigación PID2020-114627RB-I00
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Antimicrobial peptide
Published in:	mSystems, Vol. 9 (june 2024) , ISSN 2379-5077

DOI: 10.1128/msystems.01358-23
PMID: 38934543

15 p, 1.5 MB

The record appears in these collections:
Articles > Research articles
Articles > Published articles