Whole Genome Sequencing Analysis of Klebsiella pneumoniae Isolates from Health Care-Associated Bacteremia of Urinary Origin in Spain : Findings from the Multicenter ITUBRAS-2 Cohort Study
Becerra-Aparicio, F. (Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (Madrid))
Gómez-Zorrilla, Silvia (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Hernández-García, M. (Instituto de Salud Carlos III)
Xanthopoulou, K. (University of Cologne)
Gijón, D. (Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (Madrid))
Siverio Pares, Ana Cristina (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Berbel, Dàmaris (Hospital Universitari de Bellvitge)
Cercenado, Emilia (Hospital Gregorio Marañón)
Rivera, Alba (Institut de Recerca Sant Pau)
de Malet, A. (Hospital Universitario Marqués de Valdecilla (Santander, Cantabria))
Xercavins, M. (Hospital Universitari MútuaTerrassa (Terrassa, Catalunya))
Ruiz De Gopegui, E. (Hospital Universitari Son Espases (Palma de Mallorca, Balears))
Canoura-Fernández, L. (Complejo Hospitalario Universitario de Pontevedra)
Martínez, José Antonio (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Seral, C. (Hospital Clínico Universitario "Lozano Blesa" de Zaragoza)
Del Pozo, Jose Luis (Clínica Universidad de Navarra)
Cotarelo, M. (MSD Spain)
Ponz, R. (MSD Spain)
Higgins, P.G. (University of Cologne)
Duran-Jordà, Xavier (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Cantón, Rafael (Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (Madrid))
Oliver, A. (Hospital Universitari Son Espases (Palma de Mallorca, Balears))
Horcajada, Juan Pablo (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Ruiz-Garbajosa, P. (Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (Madrid))
Montesinos, I.L. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Merino, I. (Hospital Clinico de Salamanca)
de Gopegui, E.R. (Hospital Universitari Son Espases (Palma de Mallorca, Balears))
López-Causapé, C. (Hospital Universitari Son Espases (Palma de Mallorca, Balears))
Grau, I. (Hospital Universitari de Bellvitge)
Sabé, N. (Hospital Universitari de Bellvitge)
Shaw, E. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Pintado, Vicente (Hospital Universitario Ramón y Cajal (Madrid))
Padilla Ortega, Belén (Hospital General Universitario Gregorio Marañón)
Benito, Natividad (Institut de Recerca Sant Pau)
Sendra, E. (Hospital de la Santa Creu i Sant Pau (Barcelona, Catalunya))
Rubio, V. (Hospital de la Santa Creu i Sant Pau (Barcelona, Catalunya))
Boix-Palop, Lucía (Hospital Universitari MútuaTerrassa (Terrassa, Catalunya))
Badía, C. (Hospital Universitari MútuaTerrassa (Terrassa, Catalunya))
Calvo, E. (Hospital Universitari MútuaTerrassa (Terrassa, Catalunya))
Fariñas, M.C. (Hospital Universitario Marqués de Valdecilla (Santander, Cantabria))
Peñaranda, M. (Hospital Universitari Son Espases (Palma de Mallorca, Balears))
Gamallo, M.R. (Complejo Hospitalario Universitario de Pontevedra)
Morte-Romea, E. (Hospital Clínico Universitario "Lozano Blesa" de Zaragoza)
Paño-Pardo, J.R. (Hospital Clínico Universitario "Lozano Blesa" de Zaragoza)
Carmona-Torre, F. (Clínica Universidad de Navarra)
Quintano, F.T. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Carrillo, C.S. (Hospital Gregorio Marañón)
Cortarelo, M. (MSD Spain)
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina

Fecha:	2025
Resumen:	Background: The objective of this study was to assess the microbiological and clinical features of Klebsiella pneumoniae health care-associated bacteremia of urinary origin (HCA-BUO) in Spain, with a focus on third-generation cephalosporin-(3GCR-Kp) and carbapenem-resistant K pneumoniae (CR-Kp) isolates. Methods: A total of 96 (21. 4%, 96/449) K pneumoniae blood isolates were prospectively collected from patients with HCA-BUO (n = 443) from 12 tertiary care hospitals in Spain (2017-2019). Antimicrobial susceptibility was determined (standard broth microdilution), and extended-spectrum β-lactamase, AmpC, and carbapenemase production was screened. A subset of 55 K pneumoniae isolates was analyzed by whole genome sequencing (Illumina) to determine population structure, resistome, and virulome. Additionally, 13 of these isolates were subjected to long-read sequencing (Nanopore) for plasmid characterization. Patients' baseline and clinical characteristics were reviewed. Results: 3GCR-Kp prevalence was 43. 8% (42/96), mostly associated with extended-spectrum β-lactamase production (34/96, 35. 4%; mainly CTX-M-15, 32/34, 94. 1%) and the dissemination of sequence type (ST)-307 (15/34, 44. 1%) and other globally spread multidrug-resistant high-risk clones. CR-Kp prevalence was 9. 4% (9/96); all isolates belonged to different STs and were mostly associated with carbapenemase production (6/9, 66. 7%; mainly OXA-48-like, n = 3). Additionally, 3GCR-Kp and CR-Kp isolates showed higher content of other antibiotic resistance genes. Altogether, these episodes were associated with prior antibiotic use and receipt of inadequate empirical treatment. Conclusions: There is a high prevalence of 3GCR and CR-Kp causing HCA-BUO in Spain, mainly driven by the dissemination of ST307/CTX-M-15 and other globally spread multidrug-resistant high-risk clones, challenging the selection of empirical and targeted treatments for these infections.
Ayudas:	Ministerio de Economía y Competitividad RD16/0016/0004 Ministerio de Economía y Competitividad RD16/0016/0005 Ministerio de Economía y Competitividad RD16/0016/0007 Ministerio de Economía y Competitividad RD16/0016/0010 Ministerio de Economía y Competitividad RD16/0016/0011 Ministerio de Economía y Competitividad RD16/0016/0015
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Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Materia:	Klebsiella pneumoniae ; ST307 clone ; Carbapenemase-producing Enterobacterales ; Extended-spectrum β-lactamases ; Health care-associated infections
Publicado en:	Open Forum Infectious Diseases, Vol. 12 Núm. 4 (january 2025) , p. ofaf164, ISSN 2328-8957

DOI: 10.1093/ofid/ofaf164
PMID: 40201725

10 p, 790.8 KB

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