Identification of Accessible Transcription Factor Binding Sites During the Seed-to-Seedling Transition
Tremblay, Benjamin Jean-Marie (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Qüesta, Julia I. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)

Publicació:	New York: Humana, 2026
Resum:	Germination is a highly dynamic developmental transition from dry quiescent seeds to vegetative seedlings which involves major chromatin rearrangements and changes in transcriptional programs. Assay for transposase-accessible chromatin with sequencing (ATAC-seq) is a quick and reproducible method for quantifying relative chromatin accessibility genome-wide. In this chapter, we describe the use of ATAC-seq for profiling chromatin accessibility changes and differential transcription factor binding site accessibility during germination from enriched embryos.
Ajuts:	"la Caixa" Foundation 100010434 Agencia Estatal de Investigación PID2019-110510GA-I00 Agencia Estatal de Investigación EUR2021-122003 Ministerio de Ciencia e Innovación CEX2019-000902-S Agencia Estatal de Investigación RYC2021-032539-I Generalitat de Catalunya 2021/SGR-00873 Agencia Estatal de Investigación PRE2019-090156
Drets:	Aquest material està protegit per drets d'autor i/o drets afins. Podeu utilitzar aquest material en funció del que permet la legislació de drets d'autor i drets afins d'aplicació al vostre cas. Per a d'altres usos heu d'obtenir permís del(s) titular(s) de drets.
Llengua:	Anglès
Col·lecció:	Methods in Molecular Biology ; 2985
Document:	Capítol de llibre ; recerca ; Versió acceptada per publicar
Matèria:	Seed germination ; Embryos ; Tagmentation ; Chromatin accessibility ; Epigenetics ; Transcription factor binding sites ; ATAC-seq ; Nuclei
Publicat a:	Plant Transcription Factors: Methods and Protocols, 2026, p. 51-62, ISBN 978-1-0716-4972-5

DOI: 10.1007/978-1-0716-4972-5_4

Disponible a partir de: 2027-01-31 Postprint 23 p, 440.7 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > CRAG (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Llibres i col·leccions > Capítols de llibres