Mapping Cucumber Vein Yellowing Virus Resistance in Cucumber (Cucumis sativus L.) by Using BSA-seq Analysis
Pujol Abajo, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Fontaine, Anne-Sophie (Semillas Fitó S.A.)
Mayor, Patricia (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura. Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal)
Miras, Manuel (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura. Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal)
Jahrmann, Torben (Semillas Fitó S.A.)
Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Aranda, Miguel A. (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura. Departamento de Biología del Estrés y Patología Vegetal)

Data:	2019
Resum:	Cucumber vein yellowing virus (CVYV) causes severe yield losses in cucurbit crops across Mediterranean countries. The control of this virus is based on cultural practices to prevent the presence of its vector (Bemisia tabaci) and breeding for natural resistance, which requires the identification of the loci involved and the development of molecular markers for linkage analysis. In this work, we mapped a monogenic locus for resistance to CVYV in cucumber by using a Bulked Segregant Analysis (BSA) strategy coupled with whole-genome resequencing. We phenotyped 135 F families from a segregating population between a susceptible pickling cucumber and a resistant Long Dutch type cucumber for CVYV resistance. Phenotypic analysis determined the monogenic and incomplete dominance inheritance of the resistance. We named the locus CsCvy-1. For mapping this locus, 15 resistant and 15 susceptible homozygous F individuals were selected for whole genome resequencing. By using a customized bioinformatics pipeline, we identified a unique region in chromosome 5 associated to resistance to CVYV, explaining more than 80% of the variability. The resequencing data provided us with additional SNP markers to decrease the interval of CsCvy-1 to 625 kb, containing 24 annotated genes. Markers flanking CsCvy-1 in a 5. 3 cM interval were developed for marker-assisted selection (MAS) in breeding programs and will be useful for the identification of the target gene in future studies.
Ajuts:	Ministerio de Economía y Competitividad SEV-2015-0533 Ministerio de Economía y Competitividad AGL2015-72804-EXP
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a:	Frontiers in plant science, Vol. 10 (December 2019) , art. 1583, ISSN 1664-462X

DOI: 10.3389/fpls.2019.01583
PMID: 31850047

10 p, 1.6 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > CRAG (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats