Epidemiology of Echovirus 30 Infections Detected in a University Hospital in Catalonia, Spain, in 1995-2020
del Cuerpo Casas, Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Gonzalez de Audicana, Jon (Centro Nacional de Microbiología (Espanya))
Fernandez-Garcia, Maria Dolores (Centro Nacional de Microbiología (Espanya))
Marín, Pilar (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Esteban, Montserrat (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Español, Montserrat (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Cabrerizo, María (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública)
Rabella, Núria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)

Data:	2022
Resum:	There is a growing interest in echovirus 30 (E30), an enterovirus responsible for neurological disease and hospitalization. There are multiple studies of outbreaks, but few that study the epidemiology over long periods of time. Our study aims to describe the clinical, epidemiological and microbiological characteristics of a series of E30 infections detected over 26 years. Data were retrospectively collected from a database of all enterovirus infections identified in our laboratory. They were detected by viral isolation or nucleic acid detection in patients presenting with respiratory or neurological infections, rash, sepsis-like syndrome, or gastroenteritis. Enterovirus genotyping was performed by amplification of the VP1 gene using RT-nested PCR, followed by sequencing and BLAST analysis. Of the 2402 enterovirus infections detected, 1619 were linked to at least one genotype and 173 were caused by E30. Clinical information was available for 158 (91. 3%) patients. E30 was associated with neurological infection in 107 (67. 8%) cases and it was detected almost every year. Phylogenetic analysis was performed with 67 sequences. We observed that E30 strains circulating in Catalonia from 1996 to 2016 belong to two lineages (E and F), although the majority cluster was in F. In 2018, lineage I emerged as the dominant lineage.
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Enteroviruses ; Echovirus 30 ; Central nervous system ; Cerebrospinal fluid ; Phylogenetic analysis ; Epidemiology
Publicat a:	Microorganisms, Vol. 10 (march 2022) , ISSN 2076-2607

DOI: 10.3390/microorganisms10030592
PMID: 35336167

12 p, 1.5 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut de Recerca Sant Pau
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats