Single-cell Atlas of common variable immunodeficiency shows germinal center-associated epigenetic dysregulation in B-cell responses
Rodríguez-Ubreva, J. (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Arutyunyan, A. (University of Cambridge)
Bonder, M.J. (German Cancer Research Center)
Del Pino-Molina, L. (Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Universitario La Paz)
Clark, S.J. (Babraham Institute)
de la Calle-Fabregat, Carlos (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Garcia-Alonso, L. (CeWellcome Sanger Institute)
Handfield, L.F. (Wellcome Trust Sanger Institute (Regne Unit))
Ciudad, Laura (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Andrés-León, Eduardo (Instituto de Parasitología y Biomedicina "López-Neyra")
Krueger, F. (Babraham Institute)
Català-Moll, Francesc (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Rodríguez-Cortez, V.C. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Polanski, K. (Wellcome Trust Sanger Institute (Regne Unit))
Mamanova, L. (Wellcome Trust Sanger Institute (Regne Unit))
van Dongen, S. (Wellcome Trust Sanger Institute (Regne Unit))
Kiselev, V.Y. (Wellcome Trust Sanger Institute (Regne Unit))
Martínez-Saavedra, M.T. (Hospital Universitario de Gran Canaria Dr. Negrín)
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra)
Martín, Javier (Instituto de Parasitología y Biomedicina "López-Neyra")
Warnatz, K. (University of Freiburg)
López-Granados, E. (Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Universitario La Paz)
Rodríguez-Gallego, C. (University Fernando Pessoa)
Stegle, O. (Wellcome Trust Sanger Institute (Regne Unit))
Kelsey, G. (Babraham Institute)
Vento Tormo, Roser (University of Cambridge)
Ballestar, Esteban (East China Normal University)
Universitat Autònoma de Barcelona

Data:	2022
Resum:	Common variable immunodeficiency (CVID), the most prevalent symptomatic primary immunodeficiency, displays impaired terminal B-cell differentiation and defective antibody responses. Incomplete genetic penetrance and ample phenotypic expressivity in CVID suggest the participation of additional pathogenic mechanisms. Monozygotic (MZ) twins discordant for CVID are uniquely valuable for studying the contribution of epigenetics to the disease. Here, we generate a single-cell epigenomics and transcriptomics census of naïve-to-memory B cell differentiation in a CVID-discordant MZ twin pair. Our analysis identifies DNA methylation, chromatin accessibility and transcriptional defects in memory B-cells mirroring defective cell-cell communication upon activation. These findings are validated in a cohort of CVID patients and healthy donors. Our findings provide a comprehensive multi-omics map of alterations in naïve-to-memory B-cell transition in CVID and indicate links between the epigenome and immune cell cross-talk. Our resource, publicly available at the Human Cell Atlas, gives insight into future diagnosis and treatments of CVID patients.
Ajuts:	Ministerio de Economía y Competitividad PI16/01605 Ministerio de Ciencia e Innovación SAF2017-89109-P Ministerio de Economía y Competitividad PI16/00759 Instituto de Salud Carlos III AC18/00057 Agencia Estatal de Investigación PID2020-117212RB-I00
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	B-Lymphocytes ; Common Variable Immunodeficiency ; Epigenesis, Genetic ; Epigenomics ; Germinal Center ; Humans
Publicat a:	Nature communications, Vol. 13 Núm. 1 (december 2022) , p. 1779, ISSN 2041-1723

DOI: 10.1038/s41467-022-29450-x
PMID: 35365635

18 p, 9.8 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats