PyroTyping, a novel pyrosequencing-based assay for Mycobacterium tuberculosis genotyping
Molina-Moya, Barbara (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Lacoma, Alicia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
García Sierra, N. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Blanco, S. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Haba, L. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Samper, Sofía (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Respiratorias)
Ruiz Manzano, Juan (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Prat i Aymerich, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Arnold, C. (Genomic Services and Development Unit, Public Health England)
Domínguez, José (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)

Date:	2017
Abstract:	We developed a novel method, PyroTyping, for discrimination of Mycobacterium tuberculosis isolates combining pyrosequencing and IS6110 polymorphism. A total of 100 isolates were analysed with IS6110-restriction fragment length polymorphism (RFLP), spoligotyping, mycobacterial interspersed repetitive units - variable number tandem repeats (MIRU-VNTR), and PyroTyping. PyroTyping results regarding clustering or discrimination of the isolates were highly concordant with the other typing methods performed. PyroTyping is more rapid than RFLP and presents the same discriminatory power, thus, it may be useful for taking timely decisions for tuberculosis control.
Grants:	Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2009FI-B-0134 Instituto de Salud Carlos III PI07/0551 Instituto de Salud Carlos III PI15/0317 Ministerio de Economía y Competitividad PI16/01912
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Published in:	Scientific reports, Vol. 7 Núm. 6777 (july 2017) , p. 1-7, ISSN 2045-2322

DOI: 10.1038/s41598-017-06760-5
PMID: 28754991

7 p, 1.1 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Institut d'Investigació en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP)
Articles > Research articles
Articles > Published articles