Comparative analysis of tissue-specific transcriptomes in the funnel-web spider Macrothele calpeiana (Araneae, Hexathelidae)
Frías López, Cristina (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Animal)
Almeida, Francisca C. (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Animal)
Guirao-Rico, Sara (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Vizueta, Joel (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Sánchez-Gracia, Alejandro (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Arnedo, Miquel A. (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Animal)
Rozas, Julio (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)

Fecha:	2015
Resumen:	The funnel-web spider Macrothele calpeiana is a charismatic Mygalomorph with a great interest in basic, applied and translational research. Nevertheless, current scarcity of genomic and transcriptomic data of this species clearly limits the research in this non-model organism. To overcome this limitation, we launched the first tissue-specific enriched RNA-seq analysis in this species using a subtractive hybridization approach, with two main objectives, to characterize the specific transcriptome of the putative chemosensory appendages (palps and first pair of legs), and to provide a new set of DNA markers for further phylogenetic studies. We have characterized the set of transcripts specifically expressed in putative chemosensory tissues of this species, much of them showing features shared by chemosensory system genes. Among specific candidates, we have identified some members of the iGluR and NPC2 families. Moreover, we have demonstrated the utility of these newly generated data as molecular markers by inferring the phylogenetic position M. calpeina in the phylogenetic tree of Mygalomorphs. Our results provide novel resources for researchers interested in spider molecular biology and systematics, which can help to expand our knowledge on the evolutionary processes underlying fundamental biological questions, as species invasion or biodiversity origin and maintenance.
Ayudas:	Ministerio de Ciencia e Innovación BFU2010-15484 Ministerio de Economía y Competitividad CGL2013-45211 Ministerio de Economía y Competitividad CGL2012-36863 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2009/SGR-1287 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2014/SGR-1055 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2014/SGR-1604 Ministerio de Ciencia e Innovación JCI-2008-3456
Nota:	Altres ajuts: Beatriu de Pinós (Generalitat de Catalunya, 2010BP-A 00438 i 2010BP-B 00175)
Derechos:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Materia:	Evolutionary Studies ; Genetics ; Genomics ; Zoology
Publicado en:	PeerJ, Vol. 3 (June 2015) , art. e1064, ISSN 2167-8359

DOI: 10.7717/peerj.1064
PMID: 26157629

22 p, 4.8 MB

El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación > Documentos de los grupos de investigación de la UAB > Centros y grupos de investigación (producción científica) > Ciencias > CRAG (Centro de Investigación en Agrigenómica)
Artículos > Artículos de investigación
Artículos > Artículos publicados