PopHumanScan : the online catalog of human genome adaptation
Murga-Moreno, Jesus (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Coronado-Zamora, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Bodelon de Frutos, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")

Fecha:	2019
Resumen:	Since the migrations that led humans to colonize Earth, our species has faced frequent adaptive challenges that have left signatures in the landscape of genetic variation and that we can identify in our today-s genomes. Here, we (i) perform an outlier approach on eight different population genetic statistics for 22 non-admixed human populations of the Phase III of the 1000 Genomes Project to detect selective sweeps at different historical ages, as well as events of recurrent positive selection in the human lineage; and (ii) create PopHumanScan, an online catalog that compiles and annotates all candidate regions under selection to facilitate their validation and thoroughly analysis. Well-known examples of human genetic adaptation published elsewhere are included in the catalog, as well as hundreds of other attractive candidates that will require further investigation. Designed as a collaborative database, PopHumanScan aims to become a central repository to share information, guide future studies and help advance our understanding of how selection has modeled our genomes as a response to changes in the environment or lifestyle of human populations. PopHumanScan is open and freely available at https://pophumanscan. uab. cat.
Ayudas:	Ministerio de Economía y Competitividad CGL2017-89160P Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017/SGR-1379 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca FI-DGR2015
Derechos:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Materia:	Adaptation, Physiological ; Computational Biology ; Databases, Genetic ; Evolution, Molecular ; Genetics, Population ; Genome, Human ; Genomics ; Humans ; Internet ; Linkage Disequilibrium ; Models, Genetic ; Selection, Genetic
Publicado en:	Nucleic acids research, Vol. 47, issue D1 (Jan 2019) , p. D1080-D1089, ISSN 1362-4962

DOI: 10.1093/nar/gky959
PMID: 30335169

10 p, 3.7 MB

El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación > Documentos de los grupos de investigación de la UAB > Centros y grupos de investigación (producción científica) > Ciencias de la salud y biociencias > Instituto de Biotecnología y de Biomedicina (IBB)
Artículos > Artículos de investigación
Artículos > Artículos publicados