Web of Science: 30 cites, Scopus: 29 cites, Google Scholar: cites,
Evolutionary and functional impact of common polymorphic inversions in the human genome
Giner-Delgado, Carla (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Villatoro, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Lerga Jaso, Jon (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Gayà Vidal, Magdalena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Oliva Pavia, Meritxell (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Castellano Esteve, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Pantano, Lorena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Bitarello, Bárbara D. (Max-Planck-Institut für Evolutionäre Anthropologie)
Izquierdo Fontanills, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Noguera, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Olalde, Iñigo (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))
Delprat Obeaga, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Blancher, Antoine (Centre de Physiopathologie Toulouse-Purpan)
Lalueza-Fox, Carles (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))
Esko, Tõnu (Estonian Genome Center)
O'Reilly, Paul F. (King's College London. Institute of Psychiatry, Psychology & Neuroscience)
Andrés, Aida M. (Max-Planck-Institut für Evolutionäre Anthropologie)
Ferretti, Luca (University of Oxford. Big Data Institute)
Puig Font, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")

Data: 2019
Resum: Inversions are one type of structural variants linked to phenotypic differences and adaptation in multiple organisms. However, there is still very little information about polymorphic inversions in the human genome due to the difficulty of their detection. Here, we develop a new high-throughput genotyping method based on probe hybridization and amplification, and we perform a complete study of 45 common human inversions of 0. 1-415 kb. Most inversions promoted by homologous recombination occur recurrently in humans and great apes and they are not tagged by SNPs. Furthermore, there is an enrichment of inversions showing signatures of positive or balancing selection, diverse functional effects, such as gene disruption and gene-expression changes, or association with phenotypic traits. Therefore, our results indicate that the genome is more dynamic than previously thought and that human inversions have important functional and evolutionary consequences, making possible to determine for the first time their contribution to complex traits.
Ajuts: European Commission 243212
Ministerio de Ciencia e Innovación BFU2016-77244-R
Ministerio de Ciencia e Innovación BFU2013-42649-P
Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017-SGR-1379
Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2014-SGR-1346
Drets: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Llengua: Anglès
Document: Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria: Gene expression profiling ; Genome evolution ; Population genetics ; Structural variation
Publicat a: Nature communications, Vol. 10 (2019) , art. 4222, ISSN 2041-1723

DOI: 10.1038/s41467-019-12173-x
PMID: 31530810


14 p, 1.8 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut de Biotecnologia i de Biomedicina (IBB)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats

 Registre creat el 2020-06-03, darrera modificació el 2024-02-16



   Favorit i Compartir