Whole-Genome Sequencing and De Novo Assembly of 61 Isolates from Healthy Dogs and Dogs with Pyoderma
Francino, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
Pérez, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
Viñes, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
Fonticoba, Rocío (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals)
Madroñero Mateus, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular (SVGM))
Meroni, Gabriele (Surgical and Dental Sciences - One Health Unit. Department of Biomedical)
Martino, Piera A. (Surgical and Dental Sciences - One Health Unit. Department of Biomedical)
Martínez, Sofia (Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias)
Cuscó, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics)
Fábregas, Norma (Universitat Autònoma de Barcelona. Vetgenomics)
Migura-Garcia, Lourdes (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Ferrer i Caubet, Lluís (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals)

Date:	2021
Abstract:	We have de novo assembled and polished 61 genome sequences with Nanopore-only long reads. Completeness was 99. 25%. The average genome size was 2. 70 Mbp, comprising 2,506 coding sequences, 19 complete rRNAs, 56 to 59 tRNAs, and 4 noncoding RNAs (ncRNAs), as well as CRISPR arrays. We have de novo assembled and polished 61 genome sequences with Nanopore-only long reads. Completeness was 99. 25%. The average genome size was 2. 70 Mbp, comprising 2,506 coding sequences, 19 complete rRNAs, 56 to 59 tRNAs, and 4 noncoding RNAs (ncRNAs), as well as CRISPR arrays.
Grants:	Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades RTI2018-101991-B-100 Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades PTQ2018-009961 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017DI037
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Published in:	Microbiology Resource Announcements, Vol. 10 (april 2021) , ISSN 2576-098X

DOI: 10.1128/MRA.00152-21
PMID: 33888500

4 p, 347.3 KB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Grup de Recerca Malalties infeccioses-inflamatòries en animals de companyia (MIAC)
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Research group Wildlife Ecology & Health
Articles > Research articles
Articles > Published articles