Identifying miRNA-mRNA regulatory networks on extreme n-6/n-3 polyunsaturated fatty acid ratio expression profiles in porcine skeletal muscle
Manaig, Yron Joseph (Università degli Studi di Milano. Department of Veterinary Medicine and Animal Sciences)
Criado Mesas, Lourdes (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Esteve-Codina, Anna (Centre de Regulació Genòmica)
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre for Palaeogenetics)
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Folch, Josep M. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)

Fecha:	2023
Resumen:	Omega-3 (n-3) and omega-6 (n-6) polyunsaturated fatty acids (PUFAs) are essential fatty acids with antagonistic inflammatory functions that play vital roles in metabolic health and immune response. Current commercial swine diets tend to over-supplement with n-6 PUFAs, which may increase the likelihood of developing inflammatory diseases and affect the overall well-being of the animals. However, it is still poorly understood how n-6/n-3 PUFA ratios affect the porcine transcriptome expression and how messenger RNAs (mRNAs) and microRNAs (miRNAs) might regulate biological processes related to PUFA metabolism. On account of this, we selected a total of 20 Iberian × Duroc crossbred pigs with extreme values for n-6/n-3 FA ratio (10 high vs 10 low), and longissimus dorsi muscle samples were used to identify differentially expressed mRNAs and miRNAs. The observed differentially expressed mRNAs were associated to biological pathways related to muscle growth and immunomodulation, while the differentially expressed microRNAs (ssc-miR-30a-3p, ssc-miR-30e-3p, ssc-miR-15b and ssc-miR-7142-3p) were correlated to adipogenesis and immunity. Relevant miRNA-to-mRNA regulatory networks were also predicted (i. e. , mir15b to ARRDC3 ; mir-7142-3p to METTL21C), and linked to lipolysis, obesity, myogenesis, and protein degradation. The n-6/n-3 PUFA ratio differences in pig skeletal muscle revealed genes, miRNAs and enriched pathways involved in lipid metabolism, cell proliferation and inflammation.
Ayudas:	Ministerio de Ciencia e Innovación AGL2017-82641-R and PID2020-112677RB-C22 European Commission. Horizon 2020 H2020-MSCA-ITN-2017 Ministerio de Educación, Cultura y Deporte FPU15/01733 Ministerio de Economía y Competitividad CEX2019-000902-S
Derechos:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicado en:	PloS one, Vol. 18 (may 2023) , ISSN 1932-6203

DOI: 10.1371/journal.pone.0283231
PMID: 37141193

16 p, 1.4 MB

El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación > Documentos de los grupos de investigación de la UAB > Centros y grupos de investigación (producción científica) > Ciencias > CRAG (Centro de Investigación en Agrigenómica)
Artículos > Artículos de investigación
Artículos > Artículos publicados