A pan-cancer clinical platform to predict immunotherapy outcomes and prioritize immuno-oncology combinations in early-phase trials
Hernando-Calvo, Alberto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina)
Vila-Casadesús, Maria (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Bareche, Yacine (Université de Montréal)
González Medina, Alberto, 1990- (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Abbas-Aghababazadeh, Farnoosh (University Health Network (Canada))
Lo Giacco, Deborah (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Martin, Agatha (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Saavedra, Omar (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Braña, Irene (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Vieito, María (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Fasani, Roberta (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Stagg, John (Université de Montréal)
Mancuso, Francesco M. (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Haibe-Kains, Benjamin (University Health Network (Canada))
Han, Ming (University Health Network (Canada))
Berche, Roger (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Pugh, Trevor (University Health Network (Canada))
Mirallas, Oriol (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Jimenez, Jose (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Saoudi-Gonzalez, Nadia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Valverde, Claudia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Muñoz Couselo, Eva (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Suárez, Cristina (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Díez García, Marc (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Elez, Elena (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Capdevila, J. (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Oaknin, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Saura Manich, Cristina (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Macarulla Mercadé, Teresa (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Galceran, Joan Carles (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Felip, Enriqueta (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Dienstmann, Rodrigo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Bedard, Philippe L. (Princess Margaret Cancer Centre (Toronto, Canadà))
Nuciforo, Paolo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Seoane Suárez, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Tabernero, Josep (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Garralda, Elena (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)

Data:	2023
Resum:	Background: Immunotherapy is effective, but current biomarkers for patient selection have proven modest sensitivity. Here, we developed VIGex, an optimized gene signature based on the expression level of 12 genes involved in immune response with RNA sequencing. Methods: We implemented VIGex using the nCounter platform (Nanostring) on a large clinical cohort encompassing 909 tumor samples across 45 tumor types. VIGex was developed as a continuous variable, with cutoffs selected to detect three main categories (hot, intermediate-cold and cold) based on the different inflammatory status of the tumor microenvironment. Findings: Hot tumors had the highest VIGex scores and exhibited an increased abundance of tumor-infiltrating lymphocytes as compared with the intermediate-cold and cold. VIGex scores varied depending on tumor origin and anatomic site of metastases, with liver metastases showing an immunosuppressive tumor microenvironment. The predictive power of VIGex-Hot was observed in a cohort of 98 refractory solid tumor from patients treated in early-phase immunotherapy trials and its clinical performance was confirmed through an extensive metanalysis across 13 clinically annotated gene expression datasets from 877 patients treated with immunotherapy agents. Last, we generated a pan-cancer biomarker platform that integrates VIGex categories with the expression levels of immunotherapy targets under development in early-phase clinical trials. Conclusions: Our results support the clinical utility of VIGex as a tool to aid clinicians for patient selection and personalized immunotherapy interventions.
Ajuts:	Agencia Estatal de Investigación CEX2020-001024-S
Nota:	Altres ajuts: BBVA Foundation (grant 53/2021)
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a:	Med (New York), Vol. 4, Núm. 10 (October 2023) , p. 710-727.e5, ISSN 2666-6340

DOI: 10.1016/j.medj.2023.07.006

24 p, 4.8 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats