Tumor analysis of MMR genes in Lynch-like syndrome : Challenges associated with results interpretation
Rofes, Paula (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Dueñas Cid, Nuria (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Del Valle, Jesús (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Navarro, Matilde (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Balmaña Gelpí, Judith (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Ramon y Cajal, Teresa (Institut de Recerca Sant Pau)
Tuset, Noemí (Hospital Universitari Arnau de Vilanova)
Castillo, Carmen (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
González, Sara (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Brunet, Joan (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Capella, Gabriel (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Lazaro Garcia, Conxi (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Pineda, Marta (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Universitat Autònoma de Barcelona

Date:	2024
Abstract:	Up to 70% of suspected Lynch syndrome patients harboring MMR deficient tumors lack identifiable germline pathogenic variants in MMR genes, being referred to as Lynch-like syndrome (LLS). Previous studies have reported biallelic somatic MMR inactivation in a variable range of LLS-associated tumors. Moreover, translating tumor testing results into patient management remains controversial. Our aim is to assess the challenges associated with the implementation of tumoral MMR gene testing in routine workflows. Methods: Here, we present the clinical characterization of 229 LLS patients. MMR gene testing was performed in 39 available tumors, and results were analyzed using two variant allele frequency (VAF) thresholds (≥5% and ≥10%). Results and Discussion: More biallelic somatic events were identified at VAF ≥ 5% than ≥10% (35. 9% vs. 25. 6%), although the rate of nonconcordant results regarding immunohistochemical pattern increased (30. 8% vs. 20. 5%). Interpretation difficulties question the current utility of the identification of MMR somatic hits in the diagnostic algorithm of suspected LS cases.
Grants:	Instituto de Salud Carlos III PI19/00553 Agencia Estatal de Investigación PID2019-111254RB-I00 Ministerio de Economía y Competitividad CB16/12/00234
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Lynch syndrome ; Lynch-like syndrome ; Clinical management ; Mismatch repair genes ; Mismatch repair-deficiency ; Tumor testing
Published in:	Cancer Medicine, Vol. 13 Núm. 7 (april 2024) , p. e7041, ISSN 2045-7634

DOI: 10.1002/cam4.7041
PMID: 38558366

7 p, 6.6 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Institut de Recerca Sant Pau
Articles > Research articles
Articles > Published articles