A genome-wide association study for survival from a multi-centre European study identified variants associated with COVID-19 risk of death
Minnai, Francesca (Università degli Studi di Milano)
Biscarini, Filippo (Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria (IBBA))
Esposito, Martina (University of Catania)
Dragani, Tommaso A. (Aspidia S.R.L.)
Bujanda, Luis (Universidad del País Vasco)
Rahmouni, Souad (GIGA-Medical Genomics Unit. Uliege)
Alarcón-Riquelme, Marta E. (Karolinska Institute)
Bernardo, D. (Universidad de Valladolid-CSIC)
Carnero-Montoro, Elena (Universidad de Granada)
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Zeberg, Hugo (Karolinska Institutet)
Asselta, Rosanna (Humanitas Research Hospital (Itàlia))
Romero-Gómez, Manuel (Universidad de Sevilla)
Fernandez-Cadenas, Israel (Institut de Recerca Sant Pau)
Fallerini, Chiara (University of Siena)
Zguro, Kristina (University of Siena)
Croci, Susanna (University of Siena)
Baldassarri, Margherita (University of Siena)
Bruttini, Mirella (Genetica Medica. Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Furini, Simone (University of Bologna)
Renieri, Alessandra (Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Colombo, Francesca (Institute of Biomedical Technologies (Segrate, Itàlia))
Mari, F. (Genetica Medica. Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Daga, S. (University of Siena)
Meloni, I. (University of Siena)
Brunelli, G. (University of Siena)
Lista, M. (University of Siena)
Maffeo, D. (University of Siena)
Pasquinelli, E. (University of Siena)
Antolini, E. (University of Siena)
Basso, S.L. (University of Siena)
Minetto, S. (University of Siena)
Rollo, G. (University of Siena)
Rina, A. (University of Siena)
Rozza, M. (University of Siena)
Tita, R. (Genetica Medica. Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Mencarelli, M.A. (Genetica Medica. Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Rizzo, C.L. (Genetica Medica. Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Pinto, A.M. (Genetica Medica. Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Ariani, F. (Genetica Medica. Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Montagnani, F. (Azienda Ospedaliera Universitaria Senese)
Tumbarello, M. (Azienda Ospedaliera Universitaria Senese)
Rancan, I. (Azienda Ospedaliera Universitaria Senese)
Fabbiani, M. (Azienda Ospedaliera Universitaria Senese)
Cameli, Paolo (University of Siena)
Bennett, D. (University of Siena)
Anedda, F. (Siena University Hospital)
Marcantonio, S. (Siena University Hospital)
Scolletta, S. (Siena University Hospital)
Franchi, F. (Siena University Hospital)
Mazzei, M.A. (University of Siena)
Guerrini, S. (University of Siena)
Conticini, E. (University of Siena)
Cantarini, L. (University of Siena)
Frediani, B. (University of Siena)
Tacconi, D. (San Donato Hospital)
Raffaelli, C.S. (San Donato Hospital)
Emiliozzi, A. (San Donato Hospital)
Feri, M. (San Donato Hospital)
Donati, A. (San Donato Hospital)
Scala, Raffaele (San Donato Hospital)
Guidelli, L. (San Donato Hospital)
Spargi, G. (Misericordia Hospital)
Corridi, M. (Misericordia Hospital)
Nencioni, C. (Misericordia Hospital)
Croci, L. (Misericordia Hospital)
Caldarelli, G.P. (Misericordia Hospital)
Romani, D. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Piacentini, P. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Bandini, M. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Desanctis, E. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Cappelli, S. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Canaccini, A. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Verzuri, A. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Anemoli, V. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Ognibene, A. (Azienda Ospedale-Università Padova)
Lorubbio, M. (Azienda Ospedale-Università Padova)
Pancrazzi, A. (Azienda Ospedale-Università Padova)
Vaghi, M. (Ospedale Maggiore di Crema)
Monforte, A.D.' (University of Milan)
Miraglia, F.G. (University of Milan)
Mondelli, M.U. (University of Pavia)
Mantovani, S. (Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo (Itàlia))
Bruno, R. (University of Pavia)
Vecchia, M. (Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo (Itàlia))
Maffezzoni, M. (University of Pavia)
Martinelli, E. (Azienda Ospedaliera di Cremona)
Girardis, M. (University of Modena and Reggio Emilia)
Busani, S. (University of Modena and Reggio Emilia)
Venturelli, S. (University of Modena and Reggio Emilia)
Cossarizza, A. (University of Modena and Reggio Emilia)
Antinori, Andrea (IRCCS. Lazzaro Spallanzani)
Vergori, A. (IRCCS. Lazzaro Spallanzani)
Rusconi, S. (University of Milan)
Siano, M. (University of Milan)
Gabrieli, A. (University of Milan)
Riva, A. (University of Milan)
Francisci, D. ("Santa Maria Della Misericordia" Hospital)
Schiaroli, E. ("Santa Maria Della Misericordia" Hospital)
Pallotto, C. ("Santa Maria Della Misericordia" Hospital)
Parisi, S.G. (University of Padova)
Basso, M. (University of Padova)
Panese, S. (Mestre Hospital)
Baratti, S. (Mestre Hospital)
Scotton, P.G. (Treviso Hospital)
Andretta, F. (Treviso Hospital)
Giobbia, M. (Treviso Hospital)
Scaggiante, R.
Gatti, F.
Castelli, F. (University of Brescia and ASST Spedali Civili Hospital)
Quiros-Roldan, E. (University of Brescia and ASST Spedali Civili Hospital)
Antoni, M.D. (University of Brescia and ASST Spedali Civili Hospital)
Zanella, I. (Azienda Ospedaliera Spedali Civili di Brescia (Brescia, Itàlia))
Monica, M.d (Medical Genetics and Laboratory of Medical Genetics Unit. A.O.R.N. "Antonio Cardarelli")
Piscopo, Carmelo (Medical Genetics and Laboratory of Medical Genetics Unit. A.O.R.N. "Antonio Cardarelli")
Capasso, M. (CEINGE Biotecnologie Avanzate)
Russo, R. (CEINGE Biotecnologie Avanzate)
Andolfo, I. (CEINGE Biotecnologie Avanzate)
Iolascon, A. (CEINGE Biotecnologie Avanzate)
Fiorentino, Gabriella (Unit of Respiratory Physiopathology. AORN dei Colli. Monaldi Hospital)
Carella, M. (Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza)
Castori, M. (Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza)
Merla, G. (Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza)
Squeo, G.M. (Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza)
Aucella, F. (Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza)
Raggi, P. (Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza)
Perna, R. (Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza)
Bassetti, M. (Policlinico San Martino Hospital)
Di Biagio, A. (Policlinico San Martino Hospital)
Sanguinetti, M. (Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS)
Masucci, L. (Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS)
Guarnaccia, A. (Catholic University of Medicine)
Valente, S. (University of Siena)
Di Florio, A. (University of Siena)
Mandalà, M. (University of Siena)
Giorli, A. (University of Siena)
Salerni, L. (University of Siena)
Zucchi, P. (ASST Valtellina e Alto Lario)
Parravicini, P. (ASST Valtellina e Alto Lario)
Menatti, E. (Study Coordinator Oncologia Medica e Ufficio Flussi Sondrio)
Trotta, T. (Luigi Curto Hospital)
Giannattasio, F. (Luigi Curto Hospital)
Coiro, G. (Luigi Curto Hospital)
Lacerenza, G. (Misericordia Hospital)
Mussini, Cristina (University of Modena and Reggio Emilia)
Tavecchia, L. (Ospedale Bassini)
Crotti, L. (Low Prevalence and Complex Diseases of the Heart-ERN GUARD-Heart)
Parati, G. (University of Milano-Bicocca)
Menè, R. (University of Milano-Bicocca)
Sanarico, M.
Gori, Marco (Université Côte d'Azur)
Raimondi, F. (Laboratorio di Biologia Bio@SNS)
Stella, A. (Scuola Normale Superiore (Pisa, Itàlia))
Biscarini, F. (Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria (IBBA))
Bachetti, T. (Istituti Clinici Scientifici Maugeri IRCCS)
La Rovere, M.T. (Institute of Montescano)
Bussotti, M. (Institute of Milan)
Ludovisi, S. (Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico (Milà, Itàlia))
Capitani, K. (Core Research Laboratory. ISPRO)
Dei, S. (Azienda USL Toscana Sud Est)
Ravaglia, S. (IRCCS C. Mondino Foundation)
Giliberti, A. (Meyer Children's University Hospital)
Gori, G. (Meyer Children's University Hospital)
Artuso, R. (Meyer Children's University Hospital)
Andreucci, E. (Meyer Children's University Hospital)
Perrella, A. (Misericordia Hospital)
Bianchi, Federica (Misericordia Hospital)
Bergomi, P. (University of Milan)
Catena, E. (University of Milan)
Colombo, Renzo (University of Milan)
Luchi, S. (Hospital of Lucca)
Morelli, G. (Hospital of Lucca)
Petrocelli, P. (Hospital of Lucca)
Iacopini, S. (Hospital of Lucca)
Modica, S. (Hospital of Lucca)
Baroni, S. (Catholic University of the Sacred Heart)
Micheli, G. (Catholic University of the Sacred Heart)
Falcone, M. (Università di Pisa)
Urso, D. (Università di Pisa)
Tiseo, G. (Università di Pisa)
Matucci, T. (Università di Pisa)
Pulcinelli, A. (Università di Pisa)
Grassi, D. (University of L'Aquila)
Ferri, C. (University of L'Aquila)
Marinangeli, F. (University of L'Aquila)
Brancati, F. (IRCCS San Raffaele Roma)
Vincenti, A. (Hospital of Massa)
Borgo, V. (Hospital of Massa)
Lombardi, S. (Hospital of Massa)
Lenzi, M. (Hospital of Massa)
Di Pietro, M.A. (Santa Maria Annunziata Hospital)
Attala, L. (Santa Maria Annunziata Hospital)
o (Santa Maria Annunziata Hospital)
Gabbuti, A. (Santa Maria Annunziata Hospital)
Bellucci, A. (Santa Maria Annunziata Hospital)
Colaneri, M. (University of Pavia)
Casprini, P. (Laboratory of Clinical Pathology and Immunoallergy)
Pomara, C. (University of Catania)
Esposito, M. (University of Catania)
Leoncini, R. (Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Cirianni, M. (Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Galasso, L. (Azienda Ospedaliero-Universitaria Senese)
Bellini, M.A. (University of Siena)
Gabbi, C. (Karolinska Institutet (Estocolm, Suècia))
Picchiotti, N. (University of Siena)
Furini, S. (University of Bologna)
Pelo, E. (Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi)
Minuti, B. (Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi)
Gerundino, F. (Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi)
Lazzeri, C. (Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi)
Vecchi, A. (Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi)
Bianchi, L. (Meyer Children's Hospital)
Venturini, E. (Meyer Children's Hospital)
Montagnani, C. (Meyer Children's Hospital)
Chiappini, E. (Università degli Studi di Firenze)
Beltrami, C. (Meyer Children's Hospital)
Galli, L. (Università degli Studi di Firenze)
Universitat Autònoma de Barcelona

Fecha:	2024
Resumen:	The clinical manifestations of SARS-CoV-2 infection vary widely among patients, from asymptomatic to life-threatening. Host genetics is one of the factors that contributes to this variability as previously reported by the COVID-19 Host Genetics Initiative (HGI), which identified sixteen loci associated with COVID-19 severity. Herein, we investigated the genetic determinants of COVID-19 mortality, by performing a case-only genome-wide survival analysis, 60 days after infection, of 3904 COVID-19 patients from the GEN-COVID and other European series (EGAS00001005304 study of the COVID-19 HGI). Using imputed genotype data, we carried out a survival analysis using the Cox model adjusted for age, age2, sex, series, time of infection, and the first ten principal components. We observed a genome-wide significant (P-value < 5. 0 × 10) association of the rs117011822 variant, on chromosome 11, of rs7208524 on chromosome 17, approaching the genome-wide threshold (P-value = 5. 19 × 10). A total of 113 variants were associated with survival at P-value < 1. 0 × 10 and most of them regulated the expression of genes involved in immune response (e. g. , CD300 and KLR genes), or in lung repair and function (e. g. , FGF19 and CDH13). Overall, our results suggest that germline variants may modulate COVID-19 risk of death, possibly through the regulation of gene expression in immune response and lung function pathways.
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Lengua:	Anglès
Documento:	Article ; recerca ; Versió publicada
Materia:	COVID-19 ; Genetic Predisposition to Disease ; Genome-Wide Association Study ; Genotype ; Humans ; SARS-CoV-2
Publicado en:	Scientific reports, Vol. 14 Núm. 1 (december 2024) , p. 3000, ISSN 2045-2322

DOI: 10.1038/s41598-024-53310-x
PMID: 38321133

14 p, 1.9 MB

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