Automated pixel-based quantification of porcine circovirus 2 genome in formalin-fixed, paraffin-embedded tissues using in situ hybridisation
Sagrera, Mònica (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Cobos, Àlex (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Garza-Moreno, Laura (Ceva Salud Animal)
Pérez, Mònica (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
García-Buendía, Gema (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Huerta, Eva (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Llorens, Anna Maria (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Espigares, David (Ceva Salud Animal)
Sibila, Marina (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Segalés Coma, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)

Data:	2025
Resum:	Detection of porcine circovirus 2 (PCV2) in lymphoid tissues is essential for diagnostic and research purposes. In situ hybridisation (ISH) enables the localisation of viral genomes in tissue sections but is traditionally assessed visually, which may introduce subjectivity. This study developed an automated pixel classifier to quantify the PCV2 genome using RNAscope ® ISH technology. Four lymphoid tissues (tonsils and tracheobronchial, mesenteric, and superficial inguinal lymph nodes) from 66 experimentally inoculated pigs were analysed. PCV2 labelling was assessed both visually (scores 0-3) and digitally (percentage of labelled area). A strong correlation was observed between visual and digital ISH scoring (ρ = 0. 96), allowing the definition of digital thresholds corresponding to visual scores. Among all tissues, TBLN exhibited the highest PCV2 labelling. This tissue was further evaluated by PCV2 quantitative polymerase chain reaction (qPCR), showing a high correlation with digital ISH results (ρ = 0. 85). These findings demonstrate the reliability of digital pathology tools for objective quantification of PCV2 in lymphoid tissues. Automated scoring enhances consistency, reduces observer bias, and improves diagnostic efficiency in PCV2 research and surveillance.
Ajuts:	Generalitat de Catalunya 2022 DI 56
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	RNAScope® ; Digital pathology ; In situ hybridisation ; Porcine circovirus 2 ; Qpcr
Publicat a:	Frontiers in veterinary science, Vol. 12 (august 2025) , ISSN 2297-1769

DOI: 10.3389/fvets.2025.1609897
PMID: 40909940

7 p, 10.9 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA-IRTA)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats