(Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
(Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
| Títol variant: |
PARAMETRA : Una base de datos de modelización de transmisión para enfermedades del ganado |
| Data: |
2025 |
| Resum: |
La modelización dinámica de enfermedades infecciosas de importancia para la producción ganadera es una herramienta valiosa para los responsables políticos y para la toma de decisiones. Los modelos matemáticos y de simulación juegan un papel esencial en la comprensión de sistemas complejos, pero parametrizar estos modelos puede ser un desafío, especialmente en entornos con escasez de datos. Cuando los parámetros no pueden estimarse a partir de datos epidemiológicos o experimentales, a menudo es necesaria una revisión bibliográfica que consume tiempo y requiere mucha mano de obra para identificar valores adecuados basados en la literatura. Al servicio de esto, aquí presentamos PARAMETRA, una base de datos de parámetros para 20 patógenos del ganado, concebida como una herramienta colaborativa de código abierto para la comunidad investigadora para ayudar en el desarrollo de futuros modelos de transmisión de patógenos del ganado. Los patógenos incluidos en la base de datos hasta ahora se seleccionaron mediante un ejercicio de priorización de enfermedades. Los parámetros de interés fueron seleccionados por expertos con una sólida formación en epidemiología y modelización matemática. Poblamos la base de datos con más de 2000 valores individuales, cubriendo una amplia gama de diferentes parámetros, incluyendo tasas de transmisión, eficacias de pruebas diagnósticas, supervivencia de patógenos en superficies, y prevalencias a nivel de granja y regional de enfermedades seleccionadas. Finalmente, presentamos un análisis ilustrativo inicial del contenido de la base de datos y los metadatos asociados de los estudios incluidos. Una de las principales conclusiones que podemos extraer de los datos disponibles es que en muchos casos la investigación es reactiva, en lugar de proactiva, con la investigación tendiendo a centrarse en enfermedades específicas solo después de que ya hayan ocurrido brotes, como es el caso de la peste porcina africana, por ejemplo. Esto tiene implicaciones importantes para la investigación futura que se mueve hacia un enfoque más proactivo para estudios experimentales y epidemiológicos basados en observaciones de lagunas en los datos y enfermedades de alto riesgo. Esta publicación representa el primer paso en el desarrollo de la base de datos PARAMETRA, que se actualizará y ampliará en los próximos años. |
| Resum: |
Dynamic modelling of infectious diseases of importance to livestock production is a valuable tool for policy and decision makers. Mathematical and simulation models play an essential role in understanding complex systems, but parameterising these models can be challenging, especially in data-sparse environments. When parameters are unable to be estimated from epidemiological or experimental data, a time-consuming and labour-intensive literature review-to identify suitable literature-informed values-is often necessary. In service of this, here we present PARAMETRA, a parameter database for 20 pathogens of livestock, envisaged as an open-source collaborative tool for the research community to aid in the development of future transmission models of livestock pathogens. Pathogens included in the database so far were selected using a disease prioritisation exercise. Parameters of interest were selected by experts with a strong background in epidemiology and mathematical modelling. We populated the database with over 2000 individual values, covering a wide range of different parameters including transmission rates, diagnostic test efficacies, pathogen survival on surfaces, and the farm and regional level prevalences of selected diseases. Finally, we present an initial illustrative analysis of the database contents and the associated metadata of studies included. One of the principal conclusions we can draw from the data available is that in many cases research is reactive, rather than proactive, with research only tending to focus on specific diseases after outbreaks have already occurred, as is the case for African swine fever for example. This has important implications for future research moving to a more proactive approach for experimental and epidemiological studies based on observations of gaps in the data, and high-risk diseases. This publication represents the first step in development for the PARAMETRA database, which will be updated and expanded in the coming years. |
| Ajuts: |
European Commission 101083923
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| Nota: |
Altres ajuts: acords transformatius de la UAB |
| Drets: |
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| Llengua: |
Anglès |
| Document: |
Article ; recerca ; Versió publicada |
| Matèria: |
Biosecurity ;
Database ;
Epidemiology ;
Livestock ;
Livestock disease ;
Mathematical modelling ;
Modelling ;
Parameter ;
Transmission ;
Veterinary epidemiology ;
SDG 3 - Good Health and Well-being |
| Publicat a: |
Preventive veterinary medicine, Vol. 245 (2025) , p. 106668, ISSN 1873-1716 |
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