How to combine multiple tools for the genetic diagnosis work-up of pediatric B-cell acute lymphoblastic leukemia
Hidalgo-Gómez, Gloria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia)
Tazón-Vega, Bárbara (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Palacio-García, Carles (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Saumell, Silvia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Martínez-Morgado, Noemi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Navarro Garcés, Víctor (Institut d'Investigació Oncològica de Vall Hebron)
Murillo, Laura (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Velasco Puyó, Pablo (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Murciano, Thais (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Díaz de Heredia, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Bosch Albareda, Francesc 1947- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)
Armengol Rosell, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia)
Ortega, Margarita (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Servei d'Hematologia)

Data:	2025
Descripció:	16 pàg.
Resum:	This study investigated the importance of comprehensive genetic diagnosis in pediatric B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). We analyzed 175 B-ALL employing karyotyping, FISH, MLPA, targeted next-generation sequencing (t-NGS), and Optical Genome Mapping (OGM). This approach achieved an 83% classification rate, identifying 17 distinct genetic subtypes. Specifically, within B-other subtype, seven different subgroups were identified (ZNF384, IGH, DUX4, NUTM1 rearrangements, PAX5 alterations, PAX5 P80R, and IKZF1 N159Y). Secondary genetic alterations were observed, with copy number alterations (CNA) present in 60% of cases and mutations detected in 70. 6%. While these alterations exhibited specific associations with certain genetic subtypes, CNAs did not appear to significantly impact the prognosis within these genetic groups. HeH, ETV6::RUNX1, ZNF384-r, and PAX5 P80R exhibited excellent outcomes, contrasting with the poor prognoses observed in KMT2A-r, hypodiploidy, and CRLF2-r (5-year overall OS were 50%, 50%, and 52%, respectively). These findings underscore the value of integrated genetic diagnostics for accurate subtyping, risk stratification, and guiding personalized treatment in pediatric B-ALL. Therefore, optimizing diagnostic workflows for routine clinical practice is crucial. Our study confirms the utility of conventional techniques (karyotyping and FISH), combined with t-NGS and OGM, for comprehensive genetic diagnosis.
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Acute lymphoblastic leukemia ; B-other ; Genetic diagnosis ; Multiple-technique approach ; Pediatric ALL ; Precursor B-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma/genetics ; Humans ; Child, Preschool ; In Situ Hybridization, Fluorescence ; Infant ; Male ; DNA Copy Number Variations ; Genetic Testing/methods ; Karyotyping ; Adolescent ; Female ; High-Throughput Nucleotide Sequencing ; Mutation ; Child
Publicat a:	Annals of Hematology, Vol. 104, issue 4 (April 2025) , p. 2387-2402, ISSN 1279-8509

DOI: 10.1007/s00277-024-06151-7
PMID: 39843811

16 p, 2.9 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats